RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LRRK2Q5S007 2527 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 HIGD1CA8MV81 97 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 KLLNB2CW77 178 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 NXPH4O95158 308 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGKV1-17P01599 117 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LYNX1P0DP58 116 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 UBE2BP63146 152 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 PDE6HQ13956 83 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 Q6JHZ5 121 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF329Q86UD4 541 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 Q8N2B8 174 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 DKK2Q9UBU2 259 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF580Q9UK33 172 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ABCA1O95477 2261 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 POLQO75417 2590 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 A0A087WZ39 114 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LINC01546A6NGU7 62 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 H3BRN7 92 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 H7BZZ5 65 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 PLXNB1O43157 2135 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 COX7A2P2O60397 106 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF138P52744 262 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LMO4P61968 165 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CXCL6P80162 114 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 NDPQ00604 133 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF876PQ49A33 203 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 Q6ZVQ6 151 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TIMM17AQ99595 171 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 U3KQK5 164 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CENPEQ02224 2701 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 H7C423 109 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 K7EMI3 77 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGLV2-11P01706 119 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV3-33P01772 117 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 KLKP1Q107X0 134 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 PLGLAQ15195 96 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 RHOHQ15669 191 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 Q1T7F1 81 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 DYNAPQ8N1N2 210 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 Q8N9W7 124 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 SPG11Q96JI7 2443 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 A0A096LNJ9 63 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 FAM223BA6NKX1 122 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 A8MUN3 132 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 H0Y9J4 135 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 C19orf84I3L1E1 186 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 M0R381 172 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 LST1O00453 97 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 LY6HO94772 140 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 IGHV4-39P01824 125 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 COX7A1P24310 79 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 MP68P56378 58 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 BLCAPP62952 87 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-207ENST00000549400 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms