RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 MUC3AQ02505 3323 aa3.6□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 AGRNO00468 2067 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 TACC2O95359 2948 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 SPTBN2O15020 2390 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A1B0GUV1 79 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A1B0GX51 115 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A1W2PRX2 142 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 LST1O00453 97 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 COX7A2LO14548 114 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 SPINK8P0C7L1 97 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 CXCL5P42830 114 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 C2orf82Q6UX34 121 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 LITAFQ99732 161 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.59□□□□□ -1.83
AC024909.1-201ENST00000549278 MED13LQ71F56 2210 aa3.59□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGF2RP11717 2491 aa3.59□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 NBASA2RRP1 2371 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 LYRM9A8MSI8 78 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ATP5G1P05496 136 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 EDN2P20800 178 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 HILS1P60008 231 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE2BQ13066 116 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 COX17Q14061 63 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 SS18Q15532 418 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE2EQ4V326 116 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZUT4 128 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC01006Q8NI28 216 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2WQ96B02 151 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 Q9H8V8 135 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.58□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TRIAP1O43715 76 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 CKS1BP61024 79 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 DEFB136Q30KP8 78 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TTC32Q5I0X7 151 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 NRGNQ92686 78 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM104AQ969W3 186 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 PRO0255Q9UI72 69 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.57□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 AKAP6Q13023 2319 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A087WZ39 114 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 J3QKU1 62 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 DNAL4O96015 105 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 CRPP02741 224 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 APOC4P55056 127 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 PROK1P58294 105 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZSN1 163 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 DAND5Q8N907 189 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 COX7B2Q8TF08 81 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 CDIP1Q9H305 208 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.56□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 ATRXP46100 2492 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE12JA6NER3 117 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 F5H768 121 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 H7C2G1 150 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 NDUFC2O95298 119 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE4Q13068 117 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 GAGE5Q13069 117 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZTI0 123 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms