RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 CST9LQ9H4G1 147 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-208ENST00000542570 ERG28Q9UKR5 140 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.4□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM238C9JI98 176 aa7.4□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.39□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.38□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZSN1 163 aa7.38□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 TOMM6Q96B49 74 aa7.38□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 FXYD2P54710 66 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 CCL25O15444 150 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 MED14OSP0DP75 135 aa7.36□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.36□□□□□ -1.23
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TOP3A-208ENST00000542570 G3V4G9 280 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 ODF3Q96PU9 254 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 FSHBP01225 129 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf85Q96MD7 179 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 COX11Q9Y6N1 276 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 HERVK_113P63121 156 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 GAGE2EQ4V326 116 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 H3BMG7 143 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 LECT2O14960 151 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-208ENST00000542570 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 UBE2V1Q13404 147 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.33□□□□□ -1.24
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TOP3A-208ENST00000542570 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 CEND1Q8N111 149 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF580Q9UK33 172 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 A0A0J9YWU9 116 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 A4D1N5 150 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 C9JAW5 83 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 ETDBQ3ZM63 59 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 Q8N2B8 174 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 C16orf95Q9H693 158 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 LEPROTO15243 131 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 C12orf74Q32Q52 190 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TIMM17AQ99595 171 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 U3KQK5 164 aa7.31□□□□□ -1.24
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TOP3A-208ENST00000542570 A0A096LNJ9 63 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 CNFNQ9BYD5 112 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 CCL18P55774 89 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 COPS9Q8WXC6 57 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 RS1O15537 224 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 COX7A2LO14548 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 TENM4Q6N022 2769 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 RBX1P62877 108 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZTC4 211 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 M0R2N4 97 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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