RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 A0A0J9YXY3 114 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 J3QQQ9 107 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TIMM17BO60830 172 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 CCL8P80075 99 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 HES1Q14469 280 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 FAM57AQ8TBR7 257 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 C9JAW5 83 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 H3BMM0 161 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 LST1O00453 97 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 OVOL1O14753 267 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 CXCL5P42830 114 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SEC61GP60059 68 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TTC32Q5I0X7 151 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 C5orf38Q86SI9 138 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 NRGNQ92686 78 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 UBE2WQ96B02 151 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SPTBN2O15020 2390 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.42□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 FRYQ5TBA9 3013 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 E7EQL1 145 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 CNIH1O95406 144 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 APELAP0DMC3 54 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 PRR9Q5T870 116 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZQT7 251 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 Q8N9W7 124 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.41□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
TRDN-204ENST00000542443 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 H3BVH4 76 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 UQCRQO14949 82 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 CRYGAP11844 174 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 BSPH1Q075Z2 132 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 LINC00643Q86TS7 51 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 DCANP1Q8TF63 244 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 CCL17Q92583 94 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FAM104AQ969W3 186 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 MUC4Q99102 2169 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 CELA1Q9UNI1 258 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.4□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 DAND5Q8N907 189 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 TMEM101Q96IK0 257 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 METTL26Q96S19 204 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 PRORYQ9H606 182 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 PTPN13Q12923 2485 aa3.39□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FAM223BA6NKX1 122 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 H3BUA1 57 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 M0QY20 66 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 RS1O15537 224 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 TRACP01848 142 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 COX7A1P24310 79 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 MIAQ16674 131 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 C5orf47Q569G3 176 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 C2orf82Q6UX34 121 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.38□□□□□ -1.87
TRDN-204ENST00000542443 RNF182Q8N6D2 247 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms