RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 H7C2G1 150 aa7.91□□□□□ -1.14
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 VPS25Q9BRG1 176 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 CRYBA4P53673 196 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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RABGEF1-208ENST00000510829 A8MZ25 164 aa7.89□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM243Q9BU79 118 aa7.89□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BMG7 143 aa7.88□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2D3P61077 147 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2D2P62837 147 aa7.88□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE6Q13070 117 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-30P01768 117 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 CUBNO60494 3623 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0J9YXY3 114 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0U1RRA0 63 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 A4D1N5 150 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM104AQ969W3 186 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 INSL3P51460 131 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2D1P51668 147 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 HERVK_113P63121 156 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GWB2 263 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM262E9PQX1 116 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 CFC1P0CG37 223 aa7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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RABGEF1-208ENST00000510829 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 ERG28Q9UKR5 140 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 HIVEP1P15822 2718 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 Q9H8V8 135 aa7.82□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 HTN3P15516 51 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 ETDBQ3ZM63 59 aa7.81□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 F8W1H4 67 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 APOC4P55056 127 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 RBX1P62877 108 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.8□□□□□ -1.16
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