RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 F8P00451 2351 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 CFAP54Q96N23 3096 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 LINC00310P59036 64 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 CDH23Q9H251 3354 aa7.37□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 CNFNQ9BYD5 112 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 ZNF292O60281 2723 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 B5MCH6 92 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 MGAQ8IWI9 3026 aa7.36□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 F8WDY8 70 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 CRYGDP07320 174 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 F8WEM9 126 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 SOCS3O14543 225 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 SPAG11BQ08648 103 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 C9orf85Q96MD7 179 aa7.35□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.34□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 PTH2Q96A98 100 aa7.34□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 Q8N976 141 aa7.34□□□□□ -1.23
STRC-211ENST00000485556 LYRM9A8MSI8 78 aa7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 RS1O15537 224 aa7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 BRI3O95415 125 aa7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.33□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 AGRNO00468 2067 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 WFDC2Q14508 124 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 A0A0J9YXY3 114 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TSHBP01222 138 aa7.32□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 NFE4Q86UQ8 179 aa7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 ZNF580Q9UK33 172 aa7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 NDUFA1O15239 70 aa7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.31□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 LINC01620Q4KN68 170 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 MIFP14174 115 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TMEM126AQ9H061 195 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 REG3AQ06141 175 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.3□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 NDUFA7O95182 113 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TMEM223A0PJW6 202 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 CXCL5P42830 114 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 MIAQ16674 131 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 UBE2BP63146 152 aa7.29□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 IGLV1-51P01701 117 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 HAMPP81172 84 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 A8MZ25 164 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 H0YGX0 51 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 CLEC2BQ92478 149 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 UBL5Q9BZL1 73 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.28□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 USP24Q9UPU5 2620 aa7.27□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.27□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TM2D2Q9BX73 214 aa7.27□□□□□ -1.24
STRC-211ENST00000485556 TEN1Q86WV5 123 aa7.27□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 DSCR8Q96T75 97 aa7.27□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 NCR3O14931 201 aa7.27□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.27□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 LECT2O14960 151 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 RETNQ9HD89 108 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.26□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 TIRAPP58753 221 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 H7C423 109 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.25□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.24□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 SPANXCQ9NY87 97 aa7.24□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.24□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.24□□□□□ -1.25
STRC-211ENST00000485556 IGIPA6NJ69 53 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms