RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 SMARCA2P51531 1590 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PEG3Q9GZU2 1588 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 POLQO75417 2590 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 A0A1B0GV90 55 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 IGLC7A0M8Q6 106 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 H3BQ15 152 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 HMGN4O00479 90 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 SFT2D2O95562 160 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 Q6JHZ5 121 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MAPKBP1O60336 1514 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 DOCK2Q92608 1830 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 IGF2RP11717 2491 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PRDM2Q13029 1718 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MYOM2P54296 1465 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 HMGXB3Q12766 1538 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 OOSP1A8MZH6 123 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 Q8IZM0 81 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 CACNA1AO00555 2505 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 NALCNQ8IZF0 1738 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 FAM135AQ9P2D6 1515 aa0.34□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.34□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 C20orf202A1L168 122 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 C10orf142B7Z368 130 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 ABCC8Q09428 1581 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 C12orf57Q99622 126 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 KMT2DO14686 5537 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PATJQ8NI35 1801 aa0.34□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PHLPP1O60346 1717 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 MAST4O15021 2626 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 WFDC2Q14508 124 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TSLPQ969D9 159 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 VAMP8Q9BV40 100 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PRO1933Q9H354 126 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 DPH3P1Q9H4G8 78 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 MANBALQ9NQG1 85 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 WNK3Q9BYP7 1800 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CACNA1CQ13936 2221 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 SPTBN2O15020 2390 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 C10orf71Q711Q0 1435 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 MED14O60244 1454 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 WIZO95785 1651 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CUL7Q14999 1698 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 NEBP20929 6669 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 FOCADQ5VW36 1801 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TCHHQ07283 1943 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC88BA6NC98 1476 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 BCE1O60756 84 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 S100PP25815 95 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 FDCSPQ8NFU4 85 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00846Q9NV44 126 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 NESP48681 1621 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 SHROOM2Q13796 1616 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PTPN23Q9H3S7 1636 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 EEA1Q15075 1411 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 SCAPERQ9BY12 1400 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
PTPRG-202ENST00000468576 IQSEC2Q5JU85 1478 aa0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms