RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
PTPRG-202ENST00000468576 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.46■■■□□ 2.95
PTPRG-202ENST00000468576 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
PTPRG-202ENST00000468576 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PTPRG-202ENST00000468576 FOXD1Q16676 465 aa27.8■■■□□ 2.04
PTPRG-202ENST00000468576 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRG-202ENST00000468576 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRG-202ENST00000468576 ADRA2BP18089 450 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRG-202ENST00000468576 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRG-202ENST00000468576 MSH5O43196 834 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRG-202ENST00000468576 POTEDQ86YR6 584 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRG-202ENST00000468576 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRG-202ENST00000468576 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRG-202ENST00000468576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRG-202ENST00000468576 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRG-202ENST00000468576 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRG-202ENST00000468576 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRG-202ENST00000468576 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRG-202ENST00000468576 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRG-202ENST00000468576 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRG-202ENST00000468576 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRG-202ENST00000468576 KCNA4P22459 653 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRG-202ENST00000468576 RNF39Q9H2S5 420 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRG-202ENST00000468576 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRG-202ENST00000468576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRG-202ENST00000468576 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRG-202ENST00000468576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
PTPRG-202ENST00000468576 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-202ENST00000468576 SLC4A2P04920 1241 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-202ENST00000468576 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRG-202ENST00000468576 CAPN15O75808 1086 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRG-202ENST00000468576 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRG-202ENST00000468576 DSG3P32926 999 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRG-202ENST00000468576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRG-202ENST00000468576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRG-202ENST00000468576 APLP2Q06481 763 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRG-202ENST00000468576 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRG-202ENST00000468576 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRG-202ENST00000468576 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRG-202ENST00000468576 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRG-202ENST00000468576 ABCB7O75027 752 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB22O15209 634 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRG-202ENST00000468576 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRG-202ENST00000468576 POLA2Q14181 598 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRG-202ENST00000468576 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRG-202ENST00000468576 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRG-202ENST00000468576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRG-202ENST00000468576 POTEHQ6S545 545 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRG-202ENST00000468576 OSCARQ8IYS5 282 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRG-202ENST00000468576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRG-202ENST00000468576 AKT1S1Q96B36 256 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRG-202ENST00000468576 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRG-202ENST00000468576 FBLN2P98095 1184 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRG-202ENST00000468576 CHRDL2Q6WN34 429 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRG-202ENST00000468576 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE2BA6NHP3 402 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE6P0CI01 402 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRG-202ENST00000468576 PITPNM1O00562 1244 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRG-202ENST00000468576 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRG-202ENST00000468576 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRG-202ENST00000468576 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRG-202ENST00000468576 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRG-202ENST00000468576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
PTPRG-202ENST00000468576 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRG-202ENST00000468576 HAX1O00165 279 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRG-202ENST00000468576 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRG-202ENST00000468576 PRR29P0C7W0 189 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRG-202ENST00000468576 CHADLQ6NUI6 762 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRG-202ENST00000468576 EVX2Q03828 476 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRG-202ENST00000468576 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRG-202ENST00000468576 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRG-202ENST00000468576 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRG-202ENST00000468576 PROM2Q8N271 834 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRG-202ENST00000468576 CREBZFQ9NS37 354 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRG-202ENST00000468576 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRG-202ENST00000468576 GABBR2O75899 941 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRG-202ENST00000468576 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRG-202ENST00000468576 FKBP8Q14318 412 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRG-202ENST00000468576 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRG-202ENST00000468576 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.66■□□□□ 0.42
PTPRG-202ENST00000468576 CLCN6P51797 869 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRG-202ENST00000468576 POTEIP0CG38 1075 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRG-202ENST00000468576 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRG-202ENST00000468576 MIER1Q8N108 512 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRG-202ENST00000468576 PHF12Q96QT6 1004 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRG-202ENST00000468576 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
PTPRG-202ENST00000468576 PLEKHG5O94827 1062 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRG-202ENST00000468576 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRG-202ENST00000468576 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRG-202ENST00000468576 DCBLD2Q96PD2 775 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRG-202ENST00000468576 RASEFQ8IZ41 740 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRG-202ENST00000468576 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.31■□□□□ 0.36
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