RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 GAGE10A6NGK3 116 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 GAGE4Q13068 117 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 GAGE5Q13069 117 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 GAGE13Q4V321 117 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 ATRQ13535 2644 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 LINC00694P0DN24 101 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 IGLL5B9A064 214 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 FHL2Q14192 279 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 X6R8D5 127 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRN-210ENST00000460801 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.86□□□□□ -0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRN-210ENST00000460801 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRN-210ENST00000460801 TIMM17BO60830 172 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRN-210ENST00000460801 A0A0B4J2C4 111 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRN-210ENST00000460801 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.72□□□□□ -0.85
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