RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01006Q8NI28 216 aa12.76□□□□□ -0.37
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SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.72□□□□□ -0.37
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SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 TSHBP01222 138 aa12.7□□□□□ -0.38
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SH3BP4-202ENST00000392011 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2AP49459 152 aa12.69□□□□□ -0.38
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SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP4-202ENST00000392011 ATOX1O00244 68 aa12.65□□□□□ -0.38
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SH3BP4-202ENST00000392011 H7C423 109 aa12.65□□□□□ -0.38
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SH3BP4-202ENST00000392011 H3BQ85 93 aa12.63□□□□□ -0.39
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SH3BP4-202ENST00000392011 HILS1P60008 231 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-202ENST00000392011 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-202ENST00000392011 EML5Q05BV3 1969 aa12.62□□□□□ -0.39
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SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.6□□□□□ -0.39
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SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.57□□□□□ -0.4
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SH3BP4-202ENST00000392011 PDE6GP18545 87 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 IGIPA6NJ69 53 aa12.56□□□□□ -0.4
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SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 MP68P56378 58 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2D1P51668 147 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFA7O95182 113 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM258P61165 79 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
SH3BP4-202ENST00000392011 EXPH5Q8NEV8 1989 aa12.53□□□□□ -0.4
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