RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 M0R143 59 aa7.36□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 DLEU1O43261 78 aa7.36□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 HERVK_113P61574 105 aa7.36□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.36□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 HTN3P15516 51 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 NOTCH1P46531 2555 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 A0A0J9YY99 117 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 E9PLD3 99 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 F5H768 121 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 H7C423 109 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.35□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 A0A0J9YXV3 536 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 K7EIL1 84 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS2-201ENST00000299259 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.34□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 BATFQ16520 125 aa7.34□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.34□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 C12orf74Q32Q52 190 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TMEM101Q96IK0 257 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 A0A096LPF7 62 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 UBE2D1P51668 147 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 GAGE6Q13070 117 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 SPATA25Q9BR10 227 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 A0A0J9YWU9 116 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 SIVA1O15304 175 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TMEM223A0PJW6 202 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.31□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MPV17L2Q567V2 206 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TENM3Q9P273 2699 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 Q6ZTC4 211 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 HIGD1BQ9P298 99 aa7.3□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 ZNF815PA8K554 130 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 SEC11AP67812 179 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 HSD52Q0P140 79 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.29□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 LEPROTO15243 131 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TIRAPP58753 221 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 HERVK_113P63121 156 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 MRAPQ8TCY5 172 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 J3QQQ9 107 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.28□□□□□ -1.24
COPS2-201ENST00000299259 H3BNG1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 H3BRM9 83 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 TMEM262E9PQX1 116 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.27□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 A0A1B0GUV1 79 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 SPINK8P0C7L1 97 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 RBX1P62877 108 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.26□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 COX6A2Q02221 97 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 LELP1Q5T871 98 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.25□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.24□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 A0A1B0GV90 55 aa7.23□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 TAL2Q16559 108 aa7.23□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.23□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.23□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 GCSHP23434 173 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms