RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.6□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.6□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.6□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.6□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.6□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 CR1P17927 2039 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 A0A1W2PPR1 153 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 LYSTQ99698 3801 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 KLKP1Q107X0 134 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.59□□□□□ -1.67
SGIP1-201ENST00000237247 A0A0U1RQV1 116 aa4.59□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 Q1RN00 199 aa4.59□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.59□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.59□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TRBV12-3P01733 135 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RETNQ9HD89 108 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 MIAQ16674 131 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 C22orf24Q9Y442 160 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 MUC4Q99102 2169 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 SPRY2O43597 315 aa4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 K7EQG2 157 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 XCL1P47992 114 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 FAM104AQ969W3 186 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 XCL2Q9UBD3 114 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 SPTA1P02549 2419 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 SVILO95425 2214 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 USP24Q9UPU5 2620 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 F6UB75 175 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 HILS1P60008 231 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.57□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 STHQ8IWL8 128 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 CCKP06307 115 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 CLEC2BQ92478 149 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 CACNA1BQ00975 2339 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.56□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 A0A087WWL8 130 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 H7C2G1 150 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 PRSS2P07478 247 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 APC2O95996 2303 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 F5H697 171 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFC1O43677 76 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 COL12A1Q99715 3063 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 A0A0J9YXV3 536 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFA1O15239 70 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 COX7A2LO14548 114 aa4.55□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 DEFB1P60022 68 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 CD28P10747 220 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.54□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 H3BUX3 64 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 GHRHP01286 108 aa4.53□□□□□ -1.68
SGIP1-201ENST00000237247 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 FLNCQ14315 2725 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3-11P01762 117 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 C20orf197Q8N268 126 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 Q8N2B8 174 aa4.52□□□□□ -1.69
SGIP1-201ENST00000237247 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms