RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227474.7

PUS3-201, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-201ENST00000227474 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.34□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 ODF3Q96PU9 254 aa6.34□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 PRO0461Q9UI25 63 aa6.34□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 ZNF688P0C7X2 276 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 COX8AP10176 69 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 CXCL5P42830 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 Q6ZSV7 163 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 LCA10Q71F78 164 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 Q8N2B8 174 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 USP24Q9UPU5 2620 aa6.33□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 UBE2L6O14933 153 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FXYD7P58549 80 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 XCL2Q9UBD3 114 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 K7EQG2 157 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 COX7A2LO14548 114 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 PSMG4Q5JS54 123 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TIMM17AQ99595 171 aa6.32□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 E9PLD3 99 aa6.31□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 GNRH2O43555 120 aa6.31□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.31□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 VPS13CQ709C8 3753 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 A0A087WW49 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 A0A0J9YX75 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 K7ERJ3 54 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TOMM6Q96B49 74 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FBN2P35556 2912 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 IGLL5B9A064 214 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FAM229AH3BQW9 127 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 K7EMI3 77 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 PSPHP1O15172 72 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 NPC2P61916 151 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 SYNJ2BPP57105 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 LINC00315P59091 139 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 LCE3BQ5TA77 95 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 DKK2Q9UBU2 259 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.29□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 AKAP6Q13023 2319 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 COL12A1Q99715 3063 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 PPP1R17O96001 155 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 COPS9Q8WXC6 57 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 FLNCQ14315 2725 aa6.28□□□□□ -1.4
PUS3-201ENST00000227474 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 A8MTW9 85 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 CD7P09564 240 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 REG3AQ06141 175 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 SS18Q15532 418 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 ZFHX3Q15911 3703 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 hADV29S1A0JD25 119 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 IGKCP01834 107 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 PRSS1P07477 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 NFE4Q86UQ8 179 aa6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 MGPP08493 103 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 SLURP1P55000 103 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 HIGD1BQ9P298 99 aa6.24□□□□□ -1.41
PUS3-201ENST00000227474 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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