RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	DUS4	Q06063	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	THI22	Q06490	572 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	HUA2	Q12134	243 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CDC6	P09119	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PET122	P10355	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TOA1	P32773	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	EHT1	P38295	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	COS111	P38308	924 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CIR1	P42940	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	COG1	P53079	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MTL1	P53214	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MRPS35	P53292	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	AIM6	Q07716	390 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SUL2	Q12325	893 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	GCN4	P03069	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SPO16	P17122	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	VPS33	P20795	691 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MAC1	P35192	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YKR073C	P36153	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	STB5	P38699	743 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	LYS9	P38999	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	NPR2	P39923	615 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YIL077C	P40508	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RMD8	P43620	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ZAP1	P47043	880 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YAP6	Q03935	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SFI1	Q12369	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TRP3	P00937	484 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RED1	P14291	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CKA1	P15790	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	KAR4	P25583	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MRP20	P32387	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	BCS1	P32839	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PLB1	P39105	664 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YJL193W	P39542	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	NUP60	P39705	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PIG2	P40187	538 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	FKH2	P41813	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	GCN5	Q03330	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RCO1	Q04779	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	MED7	Q08278	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PRE8	P23639	250 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YCR015C	P25616	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	CDC20	P26309	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	BYE1	P36106	594 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	OMA1	P36163	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	TMN3	P40071	706 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	LRO1	P40345	661 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YIR042C	P40586	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	BAP3	P41815	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	SKP2	P42843	763 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	IDS2	P46958	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	AMA1	P50082	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	VPS4	P52917	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	COS12	P53053	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	YSA1	Q01976	231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	ARG3	P05150	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PRP28	P23394	588 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CMR3	YPR013C	DSS4	P32601	143 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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