RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	ARP7	Q12406	477 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ADH4	P10127	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YKL133C	P36066	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YPT10	P38146	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SWD1	P39706	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CRD1	Q07560	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CRT10	Q08226	957 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	OSW1	Q08692	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	AAC1	P04710	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	ATP4	P05626	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	CDC5	P32562	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YPT53	P36019	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	IMA5	P40884	581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	IDS2	P46958	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	TRS31	Q03337	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	ENT2	Q05785	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	ORC2	P32833	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	STB5	P38699	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	VFA1	P40080	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	OPT1	P40897	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MET14	Q02196	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MLC2	Q06580	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MRPL9	P31334	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	POL31	P46957	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	PIP2	P52960	996 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
UFE1	YOR075W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	CTT1	P06115	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	RPC34	P32910	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	HOT13	P36078	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YFL015C	P43578	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	TAX4	P47030	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YML122C	Q03207	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	WAR1	Q03631	944 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	VPS64	Q03944	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	AAD4	Q07747	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	GAL1	P04385	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YCR061W	P25639	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	PTP2	P29461	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	TEP1	P53916	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YNL092W	P53934	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	ACS1	Q01574	713 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	PCL8	Q08966	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	ERG11	P10614	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	LNP1	P38878	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MAM1	P40065	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	RAD26	P40352	1085 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	LAS21	P40367	830 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	TDA10	P42938	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YJL043W	P47053	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	MAD3	P47074	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	SEG1	Q04279	960 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	THI7	Q05998	598 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	NYV1	Q12255	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UFE1	YOR075W	APD1	P38281	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	QRI7	P43122	407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	SIR1	P21691	654 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	GSY2	P27472	705 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	GDA1	P32621	518 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	APM3	P38153	483 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	EXO1	P39875	702 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	HIS6	P40545	261 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	COG2	P53271	262 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	RIM13	Q03792	727 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	ORM2	Q06144	216 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	IRC3	Q06683	689 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	AIM6	Q07716	390 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	MSS18	P08593	268 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	MTG2	P38860	518 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	CRF1	Q04930	467 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UFE1	YOR075W	PIF1	P07271	859 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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