RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	CFD1	P40558	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	RNH70	P53331	553 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	PCK1	P10963	549 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	HXT4	P32467	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	DSS4	P32601	143 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	DID4	P36108	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	MAF1	P41910	395 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	YNL092W	P53934	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	AIM44	Q99299	758 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	BET2	P20133	325 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	CDC5	P32562	705 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	FLO5	P38894	1075 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	RAD33	Q04231	177 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	CRT10	Q08226	957 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	GDA1	P32621	518 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	PEF1	P53238	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	COQ3	P27680	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	UME1	Q03010	460 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	BUD7	Q08754	746 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
CSI1	YMR025W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SEC12	P11655	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	ATO2	P32907	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	YEL076C	P39971	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SNA4	Q07549	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SRL1	Q08673	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	ATP12	P22135	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	AEP2	P22136	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	MAK32	P23060	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	GPG1	P53130	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	NUP145	P49687	1317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	FTH1	P38310	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SDH8	P38345	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	PMT3	P47190	753 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
CSI1	YMR025W	YAT2	P40017	923 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	MDV1	P47025	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
CSI1	YMR025W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	YIR016W	P40572	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CIN1	P40987	1014 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	MDR1	P53258	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	YML119W	Q03208	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	NDD1	Q08887	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CBP3	P21560	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	YNL058C	P53947	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	GAL4	P04386	881 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CWH43	P25618	953 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	DAL3	P32459	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	MTG2	P38860	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	CIR1	P42940	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	IRC5	P43610	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	COG2	P53271	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	VPS5	Q92331	675 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSI1	YMR025W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	AMD2	P22580	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	ARG1	P22768	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	PEA2	P40091	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	LAS21	P40367	830 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YIL152W	P40455	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	COS12	P53053	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	BOP3	P53958	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	UBP16	Q02863	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	ATX2	Q12067	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	MNT2	P53059	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	RAD34	Q06665	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	UBX3	Q12229	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	LCB4	Q12246	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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