RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	DSS4	P32601	143 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	PMT3	P47190	753 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	RNH70	P53331	553 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	HRD3	Q05787	833 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	HER1	Q12276	1246 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	PEF1	P53238	335 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	DNM1	P54861	757 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	UME1	Q03010	460 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
SYS1	YJL004C	AIM44	Q99299	758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	CYK3	Q07533	885 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SYS1	YJL004C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	PCK1	P10963	549 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	COQ3	P27680	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	NUP145	P49687	1317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CHD1	P32657	1468 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CBP3	P21560	335 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CDC5	P32562	705 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	GCS1	P35197	352 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	LAS21	P40367	830 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CIR1	P42940	261 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.76	□□□□□ -1.81	not detected
SYS1	YJL004C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CWH43	P25618	953 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	HXT4	P32467	576 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	ATO2	P32907	282 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	MDR1	P53258	950 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	BUD7	Q08754	746 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	VPS5	Q92331	675 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	FTH1	P38310	465 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	SDH8	P38345	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YAT2	P40017	923 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	RAD26	P40352	1085 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	COG2	P53271	262 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	RAD33	Q04231	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	MMS22	Q06164	1454 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	GDA1	P32621	518 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YEL076C	P39971	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	MDV1	P47025	714 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YNL092W	P53934	400 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	SRL1	Q08673	210 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	PLC1	P32383	869 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	MAM1	P40065	302 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	PEA2	P40091	420 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	MAF1	P41910	395 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	VTC3	Q02725	835 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SYS1	YJL004C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	MAK32	P23060	363 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	MTG2	P38860	518 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	FLO5	P38894	1075 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	YIR016W	P40572	265 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	GPG1	P53130	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	BOP3	P53958	396 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	SKY1	Q03656	742 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	SNA4	Q07549	140 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	UFD4	P33202	1483 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	CIN1	P40987	1014 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	IRC5	P43610	853 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	AAT1	Q01802	451 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	ATX2	Q12067	313 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	UBX3	Q12229	455 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	YGR237C	P50089	785 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SYS1	YJL004C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82

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