RNA–Protein interactions for RNA: YHR067W

HTD2, Transcript of Mitochondrial 3-hydroxyacyl-thioester dehydratase, yeast

Gene HTD2, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTD2	YHR067W	ENT2	Q05785	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ULA1	Q12059	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	WHI2	P12611	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	VPS34	P22543	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PEX2	P32800	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	VFA1	P40080	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	QRI7	P43122	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	TEP1	P53916	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	TRS31	Q03337	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	SDH8	P38345	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	POL31	P46957	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	IDS2	P46958	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	FMP30	Q02883	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	AAD4	Q07747	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
HTD2	YHR067W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	MSS18	P08593	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PMA2	P19657	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	AAD3	P25612	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	CDC5	P32562	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	HIM1	Q06674	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	CRD1	Q07560	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	AAC1	P04710	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	CTT1	P06115	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	ATF1	P40353	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	APM3	P38153	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	YHL041W	P38730	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	YFL015C	P43578	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	YNL092W	P53934	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	VPS64	Q03944	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PCL8	Q08966	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	MRPL9	P31334	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	TPM2	P40414	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	IMO32	P53219	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	WAR1	Q03631	944 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTD2	YHR067W	PIF1	P07271	859 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	SIR1	P21691	654 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	YCR061W	P25639	631 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	MSH1	P25846	959 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	CRF1	Q04930	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	CRT10	Q08226	957 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	OSW1	Q08692	278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	POL3	P15436	1097 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	GDA1	P32621	518 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	SPC72	P39723	622 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	ATG36	P46983	293 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	TAX4	P47030	604 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	UBX4	P54730	416 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	YML119W	Q03208	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	AIM6	Q07716	390 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	ICL2	Q12031	575 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	AMD2	P22580	549 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	LNP1	P38878	278 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	EXO1	P39875	702 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	YJL043W	P47053	257 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	PHO81	P17442	1178 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	RIT1	P23796	513 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	RPC34	P32910	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	MTG2	P38860	518 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	CAB2	P40506	365 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HTD2	YHR067W	OPT1	P40897	799 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms