RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CCT6P39079 546 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SRB7P47822 140 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MIG2P53035 382 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PCL10P53124 433 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRPL50P53724 139 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GTR1Q00582 310 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C EAR1Q03212 550 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SFH1Q06168 426 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ATG23Q06671 453 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NUR1Q12066 484 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YLR122CQ12312 125 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BBP1Q12365 385 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SNA3P14359 133 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C THR1P17423 357 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRPL8P22353 238 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GSY1P23337 708 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PGS1P25578 521 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CBF2P32504 956 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SLA2P33338 968 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YKL069WP36088 180 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BAP2P38084 609 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C POM152P39685 1337 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DOT6P40059 670 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C INA22P40576 216 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SNZ3P43545 298 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YJR039WP47107 1121 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C COG2P53271 262 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TNA1P53322 534 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RET3P53600 189 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SNZ2P53824 298 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RAD33Q04231 177 aa3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.28□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ATP6P00854 259 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HOM2P13663 365 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RED1P14291 827 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ARG1P22768 420 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CNA1P23287 553 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PTP1P25044 335 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YSC84P32793 468 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YME1P32795 747 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C IES5P40060 125 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YJL070CP40361 888 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PCI8P40512 444 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FYV8P46949 817 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ORC4P54791 529 aa3.28□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YOR093CQ12275 1648 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DBF2P22204 572 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CPR3P25719 182 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DID4P36108 232 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VBA5P36172 582 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RXT2P38255 430 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ZRG8P40021 1076 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SER33P40510 469 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SPO22P40511 975 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FMS1P50264 508 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ZDS2P54786 942 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SPO75Q07798 868 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RSB1Q08417 382 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C UIP4Q08926 304 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TAF10Q12030 206 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SET6Q12529 373 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VTH1P40438 1549 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RSF2P46974 1380 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CYC7P00045 113 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YER152CP10356 443 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PHO3P24031 467 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NTG1P31378 399 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VMA6P32366 345 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KES1P35844 434 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SEA4P38164 1038 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SIP3P38717 1229 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CCC2P38995 1004 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MTW1P39731 289 aa3.27□□□□□ -1.89
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