RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	CNE1	P27825	502 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	DUN1	P39009	513 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	STL1	P39932	569 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	VID28	P40547	921 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TEP1	P53916	434 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RIM13	Q03792	727 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	BLS1	Q06071	122 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ARR3	Q06598	404 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	DGR2	P32330	852 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	XRS2	P33301	854 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YIL092W	P40497	633 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	IRC5	P43610	853 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YIP4	P53093	235 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TIM50	Q02776	476 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	FMP30	Q02883	468 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	NUR1	Q12066	484 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	SSM4	P40318	1319 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ATP12	P22135	325 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	HXT4	P32467	576 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	PSY4	P38193	441 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YLF2	P38746	405 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	PPE1	P38796	400 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	LRO1	P40345	661 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	LTP1	P40347	161 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RAD26	P40352	1085 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	THI6	P41835	540 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TAX4	P47030	604 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	SSP2	Q08646	371 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	AFT2	Q08957	416 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ICT1	Q12385	394 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RTP1	Q12751	981 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	VPS5	Q92331	675 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	AAD3	P25612	363 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TGL1	P34163	548 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YPT10	P38146	199 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	APM3	P38153	483 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	GTR1	Q00582	310 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	USA1	Q03714	838 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TRS23	Q03784	219 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TRI1	Q05024	226 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ERG11	P10614	530 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	HMG2	P12684	1045 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	APN1	P22936	367 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RER1	P25560	188 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	TMT1	P32643	299 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	HOT13	P36078	116 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	EHT1	P38295	451 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	PIH1	P38768	344 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	YEL076C	P39971	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	EAF5	P39995	279 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	COQ6	P53318	479 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	BUD17	P53727	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	CIA1	Q05583	330 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	ENT2	Q05785	613 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AIM4	YBR194W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CHS3	P29465	1165 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	IMP2'	P32351	346 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	RRN3	P36070	627 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	JNM1	P36224	373 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YHR033W	P38690	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SWD1	P39706	426 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TMA108	P40462	946 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MNT3	P40549	630 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SRB7	P47822	140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MFM1	Q02783	413 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	HIM1	Q06674	414 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	ADH4	P10127	382 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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