RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 CTR9Q6PD62 1173 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 E7EWF7 191 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 H7C1D1 291 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 PPARAQ07869 468 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 MICALL2Q8IY33 904 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 IDI2Q9BXS1 227 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 MYO1BO43795 1136 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 PICALMQ13492 652 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 NEK1Q96PY6 1258 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS2-202ENST00000570641 ST18O60284 1047 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NEK4P51957 841 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 TRDNQ13061 729 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 C12orf60Q5U649 245 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 RUFY3Q7L099 469 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NCOA7Q8NI08 942 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NBPF3Q9H094 633 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 SHTN1A0MZ66 631 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 ENTPD3O75355 529 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 TTC6Q86TZ1 520 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 WNT10BO00744 389 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CYP2D6P10635 497 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 RPS6KB1P23443 525 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NFIAQ12857 509 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 BECN1Q14457 450 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 SNX21Q969T3 373 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 KRT23Q9C075 422 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CACNB3P54284 484 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 MYH8P13535 1937 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 CLRN2A0PK11 232 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 HLA-DOAP06340 250 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NT5C2P49902 561 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 PDE4BQ07343 736 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 HSCBQ8IWL3 235 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-202ENST00000570641 NEDD4P46934 1319 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 FGRP09769 529 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 CPA1P15085 419 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 MCM5P33992 734 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 MCM2P49736 904 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 TTC14Q96N46 770 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 VEZTQ9HBM0 779 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 TOMM22Q9NS69 142 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-202ENST00000570641 GLTPD2A6NH11 291 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms