RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 DRC7Q8IY82 874 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRMPQ12912 555 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUSD4Q5VX71 490 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSIP1Q8NA03 581 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNBD1Q8NA66 436 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADD2P35612 726 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM193AP78312 1265 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 C8orf76Q96K31 380 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.55■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.54■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADALQ6DHV7 355 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PQ27 194 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PQ64 194 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PQD8 194 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF3Q9H094 633 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPLX1O14810 134 aa23.52■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 NTSR2O95665 410 aa23.52■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.52■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANO10Q9NW15 660 aa23.52■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE8BO95263 885 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE3CQ15386 1083 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRAPQ7Z569 592 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF18AQ8NI77 898 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE8AO60658 829 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 YEATS4O95619 227 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHRNA5P30532 468 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ST5P78524 1137 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERFEQ4G0M1 354 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PARP10Q53GL7 1025 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLIC4Q9Y696 253 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRDNQ13061 729 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK38Q15208 465 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP135Q66GS9 1140 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 UTRNP46939 3433 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHD4Q14839 1912 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPEP1P16444 411 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGS22Q8NE09 1264 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 NYXQ9GZU5 481 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOCK2Q92608 1830 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1B0GVL5 298 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC102BQ68D86 513 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYM6O95789 1325 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 BECN2A8MW95 431 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHKA1P46020 1223 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms