RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 INSRP06213 1382 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 KIF15Q9NS87 1388 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 KIF3BO15066 747 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 OIP5O43482 229 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TSPAN7P41732 249 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PLA2G4AP47712 749 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TMED1Q13445 227 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 EFHC2Q5JST6 749 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ARMC3Q5W041 872 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TEX19Q8NA77 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CENPTQ96BT3 561 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MPP4Q96JB8 637 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 DCAF5Q96JK2 942 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 FRMD6Q96NE9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 DONSONQ9NYP3 566 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PRQ8 180 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM37O94972 964 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BPNT1O95861 308 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CASP2P42575 452 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MAP2K3P46734 347 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 GDF10P55107 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PTK7Q13308 1070 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RASA3Q14644 834 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BRD3Q15059 726 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 HELQQ8TDG4 1101 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TAF4BQ92750 862 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MAP3K14Q99558 947 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RRAGCQ9HB90 399 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 EID1Q9Y6B2 187 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 LAMC1P11047 1609 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 C2CD2LO14523 706 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BNIP3LO60238 219 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CAND2O75155 1236 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RAPGEF3O95398 923 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 INHAP05111 366 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SETSIPP0DME0 302 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BMP4P12644 408 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SCNN1DP51172 638 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CTBSQ01459 385 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 JMYQ8N9B5 988 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 MNS1Q8NEH6 495 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BHMTQ93088 406 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 VMP1Q96GC9 406 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 COMMD8Q9NX08 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF69Q9UC07 566 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PRSS47A8MTI9 375 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 ENPP3O14638 875 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF10BO14763 440 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms