RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 CUX1P39880 1505 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 LINC01387J3KSC0 135 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 CHD1O14646 1710 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 SYNJ2O15056 1496 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 CDC25BP30305 580 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 POU4F3Q15319 338 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 PIF1Q9H611 641 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 ARAP1Q96P48 1450 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 KLF4O43474 513 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 GIPRP48546 466 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 RAB33AQ14088 237 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 MSL1Q68DK7 614 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 SYNJ1O43426 1573 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 ERBB4Q15303 1308 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 OIP5O43482 229 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 ATE1O95260 518 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 KRT76Q01546 638 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 HGSNATQ68CP4 663 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 GK5Q6ZS86 529 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-208ENST00000560725 TLDC2A0PJX2 215 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 MAOBP27338 520 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.64□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 BCRP11274 1271 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 CLCQ05315 142 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 PDE3AQ14432 1141 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 HDXQ7Z353 690 aa8.63□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 SETDB1Q15047 1291 aa8.62□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.62□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.61□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 ZNF787Q6DD87 383 aa8.61□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.61□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.6□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 GRIN3BO60391 1043 aa8.6□□□□□ -1.03
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TMOD3-208ENST00000560725 NID1P14543 1247 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SELPP16109 830 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 PDE4BQ07343 736 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SDE2Q6IQ49 451 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-208ENST00000560725 TM4SF5O14894 197 aa8.59□□□□□ -1.03
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