RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 UFL1O94874 794 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SREBF2Q12772 1141 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 COPS6Q7L5N1 327 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ARL10Q8N8L6 244 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SASH1O94885 1247 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FSTL1Q12841 308 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF790Q6PG37 636 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NEK1Q96PY6 1258 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 VCXQ9H320 206 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DACH1Q9UI36 760 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SLC8A1P32418 973 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FERMT2Q96AC1 680 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BICD1Q96G01 975 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 KRT23Q9C075 422 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 POLKQ9UBT6 870 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 KIF1BO60333 1816 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0232Q92628 1395 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DIP2AQ14689 1571 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 POTEJP0CG39 1038 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD6Q15008 389 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DLGAP5Q15398 846 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 OLFM4Q6UX06 510 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FAM50BQ9Y247 325 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA6P17066 643 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB33Q86T24 672 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 VCX3BQ9H321 246 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 KAT14Q9H8E8 782 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GRM8O00222 908 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SKILP12757 684 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FOSL1P15407 271 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 E2F6O75461 281 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GMNNO75496 209 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FLT3P36888 993 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC4P43686 418 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MECOMQ03112 1051 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPME1Q9Y570 386 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM17Q9Y577 477 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PTCH1Q13635 1447 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MYO1CO00159 1063 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BBOX1O75936 387 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM70O94826 608 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 INPP5BP32019 993 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 INAQ16352 499 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 HOOK3Q86VS8 718 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EVI5LQ96CN4 794 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NEMFO60524 1076 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CALM1P0DP23 149 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CALM2P0DP24 149 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CALM3P0DP25 149 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ERFEQ4G0M1 354 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF213O14771 459 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K7CLP57077 242 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCNA1P78396 465 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SH3GL1Q99961 368 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SIK1P57059 783 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms