RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0D9SFI3 127 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 NFIAQ12857 509 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 ADM5C9JUS6 153 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 M0R2C6 588 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 CHMLP26374 656 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 NF2P35240 595 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 PICALMQ13492 652 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 USP48Q86UV5 1035 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 FAM227BQ96M60 508 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 CDC45O75419 566 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SIPA1L1O43166 1804 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 LAMA4Q16363 1823 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 PASKQ96RG2 1323 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 CDCA5Q96FF9 252 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 TCP10Q12799 353 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 TEPSINQ96N21 525 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 ZMYM6O95789 1325 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 HLA-DOAP06340 250 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-218ENST00000525459 OTOFQ9HC10 1997 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP1BP68106 108 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF15Q66K64 600 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 TTC6Q86TZ1 520 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 CSRNP1Q96S65 589 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 TRAF5O00463 557 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SGSM2O43147 1006 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PRKAB2O43741 272 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 APPP05067 770 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 TDO2P48775 406 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 EHD4Q9H223 541 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 NAPBQ9H115 298 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 DOCK1Q14185 1865 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ALX1Q15699 326 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SBK1Q52WX2 424 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D12O60347 775 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PALD1Q9ULE6 856 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 UNCXA6NJT0 531 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K10Q02779 954 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-218ENST00000525459 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K11Q16584 847 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-218ENST00000525459 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms