RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.3■□□□□ 0.84
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.24■□□□□ 0.83
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TCHPQ9BT92 498 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SETDB1Q15047 1291 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 POSTNQ15063 836 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRDM1O75626 825 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATP5DP30049 168 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM71BQ8TC56 605 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C8orf37Q96NL8 207 aa20.23■□□□□ 0.83
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