RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 RAP1GAPP47736 663 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ISL2Q96A47 359 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 NEFLP07196 543 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ZP2Q05996 745 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 TMC1Q8TDI8 760 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.25□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 FYB2Q5VWT5 728 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 CSADQ9Y600 493 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 NDUFB5O43674 189 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 CFPP27918 469 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 FCGRTP55899 365 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 TOX2Q96NM4 488 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PICK1Q9NRD5 415 aa6.23□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ICMTO60725 284 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 SERPINB4P48594 390 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 GRM2Q14416 872 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ASB11Q8WXH4 323 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.22□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 STK35Q8TDR2 534 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CBX8Q9HC52 389 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 KRT82Q9NSB4 513 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PDE3BQ13370 1112 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PPM1JQ5JR12 505 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 SULF2Q8IWU5 870 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 LILRA6Q6PI73 481 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PI16Q6UXB8 463 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PDZD3Q86UT5 571 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 RNF214Q8ND24 703 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 DIRC2Q96SL1 478 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 GPR182O15218 404 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 TSPAN15O95858 294 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 AFMP43652 599 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ECM1Q16610 540 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 KIRREL1Q96J84 757 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 KCNK12Q9HB15 430 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 C1QTNF9P0C862 333 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP4P98171 946 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 C1QL4Q86Z23 238 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SENP6-210ENST00000487548 FAM129BQ96TA1 746 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms