RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.5□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A096LPE4 126 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PPZ6 126 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 CELA3BP08861 270 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 ID3Q02535 119 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 C8orf34Q49A92 452 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 EDEM1Q92611 657 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.49□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 ECEL1O95672 775 aa7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GALT4O96024 378 aa7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP3B2Q13367 1082 aa7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 METTL12A8MUP2 240 aa7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAC2P15153 192 aa7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 FLIIQ13045 1269 aa7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATCAYQ86WG3 371 aa7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUV39H1O43463 412 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFRSF21O75509 655 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDGFAP04085 211 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 RFX1P22670 979 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD4Q8TB40 342 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNK12Q9HB15 430 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCNJLQ8IV13 435 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 DISC1Q9NRI5 854 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.43□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTLL4Q14679 1199 aa7.43□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.43□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 A6NHS1 94 aa7.42□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 SASH1O94885 1247 aa7.42□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 EHHADHQ08426 723 aa7.42□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF385BQ569K4 471 aa7.42□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.42□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 RFXAPO00287 272 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIG1P18858 919 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATS1Q496A3 300 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA7AO75326 666 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRIA4P48058 902 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM13O60858 407 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLG4P78352 724 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXQ1Q9C009 403 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT82Q9NSB4 513 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCF12Q99081 682 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF576Q9H609 170 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP5P45974 858 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ISL2Q96A47 359 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PP55 124 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX10O60683 326 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYLIPQ8WY64 445 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF862O60290 1169 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEFMP07197 916 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFEMP1Q12805 493 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITPKAP23677 461 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC6Q86TZ1 520 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms