RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 NPR3P17342 541 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 AAMPQ13685 434 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 DISC1Q9NRI5 854 aa6.83□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ITPKAP23677 461 aa6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ZP2Q05996 745 aa6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 HOMEZQ8IX15 550 aa6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ZNF576Q9H609 170 aa6.82□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 LIG1P18858 919 aa6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 IKZF1Q13422 519 aa6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 FYB2Q5VWT5 728 aa6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 FAM13AO94988 1023 aa6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ITIH2P19823 946 aa6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 TTLL4Q14679 1199 aa6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 GJD3Q8N144 294 aa6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 KIRREL1Q96J84 757 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ARID3AQ99856 593 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 KRT82Q9NSB4 513 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.79□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 ZNF862O60290 1169 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 FZD6O60353 706 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 INHBBP09529 407 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 CTSWP56202 376 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.78□□□□□ -1.32
PHC3-211ENST00000486042 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.77□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 TMEM253P0C7T8 217 aa6.77□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.77□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.77□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CLCN7P51798 805 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 MTMR3Q13615 1198 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 KCNA10Q16322 511 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 EHD4Q9H223 541 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CD320Q9NPF0 282 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 JAG2Q9Y219 1238 aa6.75□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 NEFLP07196 543 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 MED14OSP0DP75 135 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 GDNFP39905 211 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 ISL2Q96A47 359 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.74□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 NEFMP07197 916 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 RNF214Q8ND24 703 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 DIRC2Q96SL1 478 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.73□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 ERVK-24P63145 666 aa6.72□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.72□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 CCDC120Q96HB5 630 aa6.72□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.72□□□□□ -1.33
PHC3-211ENST00000486042 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 HOXA5P20719 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 GLDCP23378 1020 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 RELTQ969Z4 430 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 C20orf173Q96LM9 149 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 ABCB6Q9NP58 842 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.71□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 SSFA2P28290 1259 aa6.7□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.7□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 FAAP100Q0VG06 881 aa6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PHC3-211ENST00000486042 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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