RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 NYXQ9GZU5 481 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 LY9Q9HBG7 655 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 HPSEQ9Y251 543 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-209ENST00000477552 SMC2O95347 1197 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 SKILP12757 684 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 PFKFB1P16118 471 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 TUBB4BP68371 445 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 FAM193AP78312 1265 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 MYL5Q02045 173 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 DDB1Q16531 1140 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 IQCA1Q86XH1 822 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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PTPRD-209ENST00000477552 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-209ENST00000477552 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.61□□□□□ -0.87
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