RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 JAK2O60674 1132 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 DTNBO60941 627 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 STYK1Q6J9G0 422 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 MPNDQ8N594 471 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 KIF3AQ9Y496 699 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 MTA3Q9BTC8 594 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 H0YIN7 160 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 LDHCP07864 332 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 KDM4AO75164 1064 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CTDNEP1O95476 244 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 COA1Q9GZY4 146 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 INCENPQ9NQS7 918 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.161e-11■■□□□ 12.6
SYF2-204ENST00000476231 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 LIFRP42702 1097 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 TTC6Q86TZ1 520 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CERS3Q8IU89 383 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 BAG3O95817 575 aa22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CTR9Q6PD62 1173 aa22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RNF214Q8ND24 703 aa22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 PPP4CP60510 307 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 GRIK5Q16478 980 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 DDX11Q96FC9 970 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 LY9Q9HBG7 655 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 TOMM22Q9NS69 142 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 LAMB1P07942 1786 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 FGRP09769 529 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SBK1Q52WX2 424 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ESR2Q92731 530 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 EYA3Q99504 573 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 USP17L12C9JPN9 530 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 USP17L21D6R901 530 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RIMBP2O15034 1052 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RESTQ13127 1097 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ATL3Q6DD88 541 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 APOA5Q6Q788 366 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SLF2Q8IX21 1173 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 OLFM4Q6UX06 510 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CNKSR1Q969H4 720 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ERICH2A1L162 156 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 H3BQV1 296 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 IFFO2Q5TF58 517 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 TMTC2Q8N394 836 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SPATA32Q96LK8 384 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CPLX1O14810 134 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 FERMT3Q86UX7 667 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CFAP45Q9UL16 551 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 CCDC69A6NI79 296 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB43O43298 467 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 GTF2IP78347 998 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-204ENST00000476231 RGS22Q8NE09 1264 aa22.21■■□□□ 1.15
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