RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	SORBS3	O60504	671 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KIF20A	O95235	890 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	S1PR4	O95977	384 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IGHA1	P01876	353 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RAC2	P15153	192 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MRE11	P49959	708 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RENBP	P51606	427 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RCAN1	P53805	252 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L24	Q0WX57	530 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SQSTM1	Q13501	440 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MORC1	Q86VD1	984 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	HAUS7	Q99871	368 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TOR1B	O14657	336 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SPTLC2	O15270	562 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	AKR1B10	O60218	316 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KATNA1	O75449	491 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CHMP4BP1	P59074	171 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PIP4K2B	P78356	416 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PTK2	Q05397	1052 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT17	Q6IS24	598 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TMC4	Q7Z404	712 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MRS2	Q9HD23	443 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CEP72	Q9P209	647 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO10	Q9UK96	956 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0B4J203	849 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IL33	O95760	270 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CTSH	P09668	335 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IDE	P14735	1019 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G4A	P47712	749 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GJA8	P48165	433 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RXRG	P48443	463 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GRM1	Q13255	1194 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SLMAP	Q14BN4	828 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L3	A6NCW0	530 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L4	A6NCW7	530 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RASSF10	A6NK89	507 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	C21orf2	O43822	256 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ARIH2	O95376	493 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SLC4A1	P02730	911 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MME	P08473	750 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RPIA	P49247	311 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8	2e-6	■■■■□ 24.2
TTC3-214	ENST00000472398	TMED1	Q13445	227 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	IRGC	Q6NXR0	463 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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