RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCO2Q9BYV7 579 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAPKBP1O60336 1514 aa4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PRNPP04156 253 aa4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNB2Q92953 911 aa4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 KRT82Q9NSB4 513 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.96□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDZD3Q86UT5 571 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 STK35Q8TDR2 534 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF114Q9Y508 228 aa4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 SETD5Q9C0A6 1442 aa4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4.94□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 TTLL4Q14679 1199 aa4.94□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXL18Q96ME1 805 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.93□□□□□ -1.62
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RNU6-55P-201ENST00000411092 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCER2I3L3R5 266 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 NME2P22392 152 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 SETDB2Q96T68 719 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 CBX8Q9HC52 389 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 NEFMP07197 916 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL19A1Q14993 1142 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 CBLL1Q75N03 491 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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