RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A096LPE4 126 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PPZ6 126 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 METTL12A8MUP2 240 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR182O15218 404 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 AOC2O75106 756 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDK5R2Q13319 367 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIDD1Q9HB75 910 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LGR6Q9HBX8 967 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TREHO43280 583 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 B3GALT4O96024 378 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD96P40200 585 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 OXCT1P55809 520 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 AP3B2Q13367 1082 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDE3AQ14432 1141 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCNJLQ8IV13 435 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBF1Q8TES7 1133 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASB16Q96NS5 453 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR18Q9BV38 432 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAK1Q9UPV9 953 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 NFIBO00712 420 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMPRSS2O15393 492 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 AFMP43652 599 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 FGD1P98174 961 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 DSC3Q14574 896 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMC7Q7Z402 723 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASB11Q8WXH4 323 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CSRNP1Q96S65 589 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PP55 124 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ECEL1O95672 775 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 GLI1P08151 1106 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLFN14P0C7P3 912 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITPKAP23677 461 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAPK1P28482 360 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRIA4P48058 902 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 IKZF1Q13422 519 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 MPZL3Q6UWV2 235 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 AMIGO3Q86WK7 504 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMC1Q8TDI8 760 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCF12Q99081 682 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLAGL2Q9UPG8 496 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTNND2Q9UQB3 1225 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 U3KQE9 123 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 GIPC1O14908 333 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ID3Q02535 119 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZP2Q05996 745 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ORC1Q13415 861 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPRED3Q2MJR0 410 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF576Q9H609 170 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 NPHS2Q9NP85 383 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-407P-201ENST00000365280 LEFTY1O75610 366 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1QTNF9P0C862 333 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERCC3P19447 782 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITIH2P19823 946 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTSWP56202 376 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLCB3Q01970 1234 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIRREL1Q96J84 757 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms