RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362954.1

RNU6-199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-199P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-199P-201ENST00000362954 MPSTP25325 297 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ID3Q02535 119 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TPRNQ4KMQ1 711 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PRDM7Q9NQW5 492 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 KRT82Q9NSB4 513 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NFIBO00712 420 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZNF862O60290 1169 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 FZD6O60353 706 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NEFMP07197 916 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 HOXA5P20719 270 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 GLDCP23378 1020 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ATP2B4P23634 1241 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CLCN7P51798 805 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CTSWP56202 376 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 KRTAP10-2P60368 255 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZP2Q05996 745 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 KIRREL1Q96J84 757 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 LGR6Q9HBX8 967 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 GDNFP39905 211 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TTLL4Q14679 1199 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 KCNA10Q16322 511 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TTC16Q8NEE8 873 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PIDD1Q9HB75 910 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 SLFN14P0C7P3 912 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 IKZF1Q13422 519 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PDE3AQ14432 1141 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CYFIP1Q7L576 1253 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PDZD3Q86UT5 571 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ISL2Q96A47 359 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 LIG1P18858 919 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NTF4P34130 210 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 RNF214Q8ND24 703 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ABCB6Q9NP58 842 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ITIH2P19823 946 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 LINC00310P59036 64 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ERVK-24P63145 666 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 FAAP100Q0VG06 881 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CIAPIN1Q6FI81 312 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 MPZL3Q6UWV2 235 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 ATG14Q6ZNE5 492 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 RELTQ969Z4 430 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 CSRNP1Q96S65 589 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-199P-201ENST00000362954 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 FAM13AO94988 1023 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM253P0C7T8 217 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 KCNC2Q96PR1 638 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 EOMESO95936 686 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 RING1Q06587 406 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 EPB41L4BQ9H329 900 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 PRDM10Q9NQV6 1147 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 SSFA2P28290 1259 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 NFKB2Q00653 900 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 MTMR3Q13615 1198 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 CCDC120Q96HB5 630 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 DIRC2Q96SL1 478 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 CCDC87Q9NVE4 849 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms