RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PSMA5P28066 241 aa26.3■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 FLT1P17948 1338 aa26.3■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 E7EWF7 191 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 PPARAQ07869 468 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 PICALMQ13492 652 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 SBK1Q52WX2 424 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 NBPF3Q9H094 633 aa26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 NEK1Q96PY6 1258 aa26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.28■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 H7C1D1 291 aa26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 IDI2Q9BXS1 227 aa26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CTU2-201ENST00000312060 WNT10BO00744 389 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 NEK4P51957 841 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CACNB3P54284 484 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 NFIAQ12857 509 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 MYO1BO43795 1136 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CYP2D6P10635 497 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 C12orf60Q5U649 245 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.25■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CLRN2A0PK11 232 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 SMIM22K7EJ46 135 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CPA1P15085 419 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TRDNQ13061 729 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 RUFY3Q7L099 469 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTU2-201ENST00000312060 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
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CTU2-201ENST00000312060 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.23■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 NCOA7Q8NI08 942 aa26.23■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.23■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ST18O60284 1047 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 PLCD1P51178 756 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 EVX2Q03828 476 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TCP10Q12799 353 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 IL27Q8NEV9 243 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 INCENPQ9NQS7 918 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 RPS6KB1P23443 525 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 EPS15P42566 896 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 TTC6Q86TZ1 520 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-201ENST00000312060 ENTPD3O75355 529 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 VEZTQ9HBM0 779 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 NEDD4P46934 1319 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 SNX21Q969T3 373 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TOMM22Q9NS69 142 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 MYH8P13535 1937 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 GLTPD2A6NH11 291 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 FGRP09769 529 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 PDE4BQ07343 736 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TTC14Q96N46 770 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 KRT23Q9C075 422 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 B4E1Z4 1266 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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