RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TNNC1P63316 161 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MCUQ8NE86 351 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ABHD8Q96I13 439 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 NGLY1Q96IV0 654 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 GSTA4O15217 222 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 IRX4P78413 519 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZBTB33Q86T24 672 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SCOCQ9UIL1 159 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TMED1Q13445 227 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 FLOT2Q14254 428 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 IWS1Q96ST2 819 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KRT83P78385 493 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 STRN3Q13033 797 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PPFIA4O75335 1185 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 LIN9Q5TKA1 542 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 NBNO60934 754 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PEX19P40855 299 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZNF263O14978 683 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 EFCAB14O75071 495 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KRT2P35908 639 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 Q9H521 79 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 H3BRJ5 948 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PFDN6O15212 129 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 NOX5Q96PH1 765 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 OCRLQ01968 901 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 AAMPQ13685 434 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MTRQ99707 1265 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 GCKP35557 465 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TRAF1Q13077 416 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 E9PMD0 336 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CAPN9O14815 690 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TNFAIP3P21580 790 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ECE1P42892 770 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZNF165P49910 485 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TTC22Q5TAA0 569 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 PALMDQ9NP74 551 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 UBXN8O00124 270 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SKIP12755 728 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 GSTO1P78417 241 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 NR1I2O75469 434 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 HOOK2Q96ED9 719 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SNRKQ9NRH2 765 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 TNNI2P48788 182 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KRT81Q14533 505 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 DHX58Q96C10 678 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 DIAPH2O60879 1101 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 WTAPQ15007 396 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 OTULINQ96BN8 352 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 COG4Q9H9E3 785 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 KIF11P52732 1056 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 HS1BP3Q53T59 392 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS3-201ENST00000311160 BBOF1Q8ND07 529 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms