RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 PICALMQ13492 652 aa29.86■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.86■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 USP17L12C9JPN9 530 aa29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 USP17L21D6R901 530 aa29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 EGFRP00533 1210 aa29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 CTR9Q6PD62 1173 aa29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 CACNB3P54284 484 aa29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 NFIAQ12857 509 aa29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 IDI2Q9BXS1 227 aa29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 MYO1BO43795 1136 aa29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.84■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 SBK1Q52WX2 424 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 CLRN2A0PK11 232 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 EPS15P42566 896 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 PPARAQ07869 468 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 NBPF3Q9H094 633 aa29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
NTN3-201ENST00000293973 GLTPD2A6NH11 291 aa29.82■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 KRT32Q14532 448 aa29.82■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.81■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 CYP2D6P10635 497 aa29.8■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.8■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.8■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.8■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 E7EWF7 191 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 TCP10Q12799 353 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 RABEP1Q15276 862 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 C12orf60Q5U649 245 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.79■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 SMIM22K7EJ46 135 aa29.78■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 VEZTQ9HBM0 779 aa29.78■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 EVX2Q03828 476 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 TM6SF1Q9BZW5 370 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 ENTPD3O75355 529 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 PSMA5P28066 241 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NTN3-201ENST00000293973 PLCD1P51178 756 aa29.76■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.76■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.76■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.75■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 NEK1Q96PY6 1258 aa29.75■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.75■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 SCN4AP35499 1836 aa29.74■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.74■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa29.74■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 TTC6Q86TZ1 520 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 INCENPQ9NQS7 918 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 HACL1Q9UJ83 578 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 NEDD4P46934 1319 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 TRDNQ13061 729 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 WDR90Q96KV7 1748 aa29.73■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 NEK4P51957 841 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 FAM83AQ86UY5 434 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 NCOA7Q8NI08 942 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 CNTNAP1P78357 1384 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 HLA-DOAP06340 250 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 CPA1P15085 419 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 RUFY3Q7L099 469 aa29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NTN3-201ENST00000293973 FAM151AQ8WW52 585 aa29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms