RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261590.12

DSG2-201, Transcript of desmoglein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DSG2, Length 5,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2-201ENST00000261590 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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DSG2-201ENST00000261590 RSPH3Q86UC2 560 aa24.85■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.85■■□□□ 1.57
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DSG2-201ENST00000261590 MUM1Q2TAK8 710 aa24.83■■□□□ 1.57
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DSG2-201ENST00000261590 MAP2K2P36507 400 aa24.83■■□□□ 1.57
DSG2-201ENST00000261590 MAN1A1P33908 653 aa24.83■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 BEND3Q5T5X7 828 aa24.82■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 SETDB2Q96T68 719 aa24.82■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 FANCCQ00597 558 aa24.82■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 USTQ9Y2C2 406 aa24.82■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.82■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 NLRP3Q96P20 1036 aa24.82■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.561e-9■■■■■ 27.6
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DSG2-201ENST00000261590 PLCG2P16885 1265 aa24.81■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.562e-9■■■■□ 21.4
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DSG2-201ENST00000261590 NUP58Q9BVL2 599 aa24.81■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 HVCN1Q96D96 273 aa24.8■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 CHMP2AO43633 222 aa24.79■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.79■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 DENND2CQ68D51 928 aa24.79■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 KRT71Q3SY84 523 aa24.79■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.79■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 STX2P32856 288 aa24.77■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 LRRC43Q8N309 656 aa24.77■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 COG7P83436 770 aa24.77■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.77■■□□□ 1.56
DSG2-201ENST00000261590 SLC12A2P55011 1212 aa24.77■■□□□ 1.56
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DSG2-201ENST00000261590 STRN3Q13033 797 aa24.76■■□□□ 1.55
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