RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000182527.3

TRAM2-201, Transcript of translocation associated membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAM2, Length 6,908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-201ENST00000182527 ALAS1P13196 640 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 A1BGP04217 495 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SASH1O94885 1247 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ITGA6P23229 1130 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SKA1Q96BD8 255 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.5□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 AMHP03971 560 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 FAM161BQ96MY7 647 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 USP17L5A8MUK1 530 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 OATP04181 439 aa8.5□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 METTL23Q86XA0 190 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 PTPAQ15257 358 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 IGBP1P78318 339 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 GPS2Q13227 327 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.49□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 GNAT2P19087 354 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 PSMC4P43686 418 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CETN2P41208 172 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 GABPAQ06546 454 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SP8Q8IXZ3 490 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.49□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 HAUS7Q99871 368 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ASB14A6NK59 587 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 TNFAIP2Q03169 654 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.056e-7■□□□□ 10.3
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TRAM2-201ENST00000182527 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 RTL1A6NKG5 1358 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 PTH1RQ03431 593 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ABHD8Q96I13 439 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 CETN1Q12798 172 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRAM2-201ENST00000182527 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 COL15A1P39059 1388 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 GJB1P08034 283 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 KANK3Q6NY19 840 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 IFT74Q96LB3 600 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 MED10Q9BTT4 135 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAM2-201ENST00000182527 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.47□□□□□ -1.05
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