RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 GnptabQ69ZN6 1235 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 LdhdQ7TNG8 484 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stac3Q8BZ71 360 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Xrcc4Q924T3 326 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dynll2Q9D0M5 89 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnip1Q9WUU8 647 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif20aP97329 887 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gjb2Q00977 226 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam170aQ66LM6 333 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tceanc2Q8R2M0 207 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atxn7Q8R4I1 867 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ndufv1Q91YT0 464 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa16.3■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scn10aQ6QIY3 1958 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atrnl1Q6A051 1378 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Irgm2A0A140LIF8 407 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sptbn5F6UCX4 1208 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lipo1J3QME6 396 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 F2rP30558 430 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam178bQ24JP3 464 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmprss11eQ5S248 423 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmc4Q7TQ65 694 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rassf8Q8CJ96 419 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lman1lQ8VCD3 505 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc7Q9D541 371 aa16.28■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm29094F6Q785 221 aa16.27■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc174Q3U155 467 aa16.27■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ehmt1Q5DW34 1296 aa16.27■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ErmnQ5EBJ4 281 aa16.27■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa16.27■□□□□ 0.2
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa16.27■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ano3A2AHL1 981 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam186bD3Z420 943 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abl1P00520 1123 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Il7P10168 154 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ptpn12P35831 775 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 LeprP48356 1162 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lgr6Q3UVD5 967 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adgre1Q61549 931 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm21985Q6P6P5 1106 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rufy3Q9D394 469 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zbtb43Q9DAI4 467 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sil1Q9EPK6 465 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phactr2B1AVP0 632 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ces1aE9PYP1 563 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 EvcP57680 1005 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem39bQ810L4 492 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Txnrd2Q9JLT4 524 aa16.26■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Med23Q80YQ2 1367 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Col2a1P28481 1487 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Prss51A0A286YDY8 319 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnni2P13412 182 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf667Q2TL60 609 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 VrtnQ3SYK4 740 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Prdm1Q60636 856 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc44a1Q6X893 653 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 KhnynQ80U38 671 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 OplahQ8K010 1288 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdk8Q8R3L8 464 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppm1gQ61074 542 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gbp7Q91Z40 638 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q9D9S1 216 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dpp7Q9ET22 506 aa16.24■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TicrrQ8BQ33 1889 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vwa3bJ9JI28 736 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ftl1P29391 183 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sec23aQ01405 765 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Htatsf1Q8BGC0 757 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PaoxQ8C0L6 504 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fzd9Q9R216 592 aa16.23■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Clrn2B2RVW2 232 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pde6aP27664 859 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Psen2Q61144 448 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam196bQ6GQV1 535 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem59lQ7TNI2 337 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rnf41Q8BH75 317 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trpm7Q923J1 1863 aa16.22■□□□□ 0.19
Ptx4-201ENSMUST00000054930 UtrnE9Q6R7 3430 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms