RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C DCW1P36091 449 aa5.37□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C ATH1P48016 1211 aa5.37□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C YJL171CP46992 396 aa5.36□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C ULI1P43604 169 aa5.35□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C EAP1P36041 632 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C YGR273CP53329 174 aa5.34□□□□□ -1.55
YKL111CYKL111C HTA1P04911 132 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C HTA2P04912 132 aa5.33□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C UBP14P38237 781 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C ILV3P39522 585 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C CKB1P43639 278 aa5.32□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C DAN4P47179 1161 aa5.32□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C LDB19Q12502 818 aa5.32□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C YEL023CP39992 682 aa5.3□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C REF2P42073 533 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C MPH3P0CE00 602 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C PTC4P38089 393 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C YDR090CQ03193 310 aa5.29□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C JIP4Q03361 876 aa5.28□□□□□ -1.56
YKL111CYKL111C AI4P03878 556 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C KEX1P09620 729 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C VHR2P40041 505 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C BMT6Q12291 365 aa5.27□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C DSF2P38213 736 aa5.26□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C PBS2P08018 668 aa5.25□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C RTG1P32607 177 aa5.25□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
YKL111CYKL111C COX6P00427 148 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C SEC61P32915 480 aa5.23□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C LEU3P08638 886 aa5.22□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YKL111CYKL111C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C RAD54P32863 898 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C SLI15P38283 698 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C NCR1Q12200 1170 aa5.2□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C MID1P41821 548 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C PML39Q03760 334 aa5.18□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C MAM3Q12296 706 aa5.17□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C ORC6P38826 435 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C YDL129WQ07555 291 aa5.16□□□□□ -1.58
YKL111CYKL111C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C DIT2P21595 489 aa5.15□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C IES2P40154 320 aa5.15□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C YDR344CQ05510 147 aa5.15□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C CDC73Q06697 393 aa5.14□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C KIC1P38692 1080 aa5.13□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C MPC54Q08550 464 aa5.13□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C SAP30P38429 201 aa5.11□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C PEX29Q03370 554 aa5.1□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C DPL1Q05567 589 aa5.1□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C RGR1P19263 1082 aa5.09□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKL111CYKL111C MVP1P40959 511 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C ARH1P48360 493 aa5.08□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C NMA111P53920 997 aa5.07□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C CSC1Q06538 782 aa5.07□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C GLC3P32775 704 aa5.06□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C LEO1P38439 464 aa5.06□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C TFB4Q12004 338 aa5.05□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C ISU2Q12056 156 aa5.05□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C HAP5Q02516 242 aa5.04□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C PRE3P38624 215 aa5.03□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C AIM7Q12156 149 aa5.03□□□□□ -1.6
YKL111CYKL111C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C YPR109WQ06104 294 aa5.02□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C PDR1P12383 1068 aa5.01□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C RAM1P22007 431 aa5.01□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C BNI4P53858 892 aa5.01□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C BCK2P33306 851 aa5□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C YRR1Q12172 810 aa5□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C KIN1P13185 1064 aa4.99□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C SPT23P35210 1082 aa4.99□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C YPR015CQ12531 247 aa4.99□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C PEX21P50091 288 aa4.98□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C CLB5P30283 435 aa4.97□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C TEA1P47988 759 aa4.97□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C ATF2P53296 535 aa4.97□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YKL111CYKL111C SIT4P20604 311 aa4.96□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C STR2P47164 639 aa4.96□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C NIS1P53939 407 aa4.96□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C NUD1P32336 851 aa4.94□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C ISM1P48526 1002 aa4.94□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C PTC2P39966 464 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C FPK1P53739 893 aa4.93□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C ERF2Q06551 359 aa4.93□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C TY1A-DR4O74302 440 aa4.92□□□□□ -1.62
YKL111CYKL111C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8 ms