RNA–Protein interactions for RNA: YHR197W

RIX1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene RIX1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIX1	YHR197W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RIX1	YHR197W	SOL3	P38858	249 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RIX1	YHR197W	RLF2	Q12495	606 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RIX1	YHR197W	RTG1	P32607	177 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	GYP5	Q12344	894 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	COQ8	P27697	501 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	DCW1	P36091	449 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	SEC61	P32915	480 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	MIF2	P35201	549 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	YEL023C	P39992	682 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	HTA2	P04912	132 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RIX1	YHR197W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	PTC4	P38089	393 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	YJL171C	P46992	396 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	JIP4	Q03361	876 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	BMT6	Q12291	365 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	GUT1	P32190	709 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	CKB1	P43639	278 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	ATH1	P48016	1211 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RIX1	YHR197W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.34	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	SAP30	P38429	201 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	YGR273C	P53329	174 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	MID1	P41821	548 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	PML39	Q03760	334 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	AI4	P03878	556 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	AIM44	Q99299	758 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	YML020W	Q03722	664 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RIX1	YHR197W	PRE3	P38624	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	SLI15	P38283	698 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	KEX1	P09620	729 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	YDR090C	Q03193	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	ARH1	P48360	493 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	MPC54	Q08550	464 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
RIX1	YHR197W	PEX29	Q03370	554 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	KIN1	P13185	1064 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RIX1	YHR197W	DSF2	P38213	736 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	VHR2	P40041	505 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	RAM1	P22007	431 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	MAM3	Q12296	706 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	BCK2	P33306	851 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	SLX8	P40072	274 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	CDC73	Q06697	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	MRX12	P47084	519 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	VPS70	P47161	811 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	NMA111	P53920	997 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	HAP5	Q02516	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	DPL1	Q05567	589 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	GEF1	P37020	779 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	BNI4	P53858	892 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	RAD54	P32863	898 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	VRP1	P37370	817 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	ATG36	P46983	293 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RIX1	YHR197W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	SPT23	P35210	1082 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	AIM7	Q12156	149 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	TOP1	P04786	769 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	PDR1	P12383	1068 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	GLC3	P32775	704 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	XDJ1	P39102	459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	ORC6	P38826	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	COX6	P00427	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	PBS2	P08018	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	SDH2	P21801	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	ISU2	Q12056	156 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	DIT2	P21595	489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RIX1	YHR197W	KIC1	P38692	1080 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RIX1	YHR197W	SRC1	Q03707	834 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RIX1	YHR197W	LAM6	Q08001	693 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RIX1	YHR197W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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