RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	NUP159	P40477	1460 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPS100	YHR139C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPS100	YHR139C	MLP2	P40457	1679 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SPS100	YHR139C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPS100	YHR139C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPS100	YHR139C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPS100	YHR139C	SNT2	P53127	1403 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPS100	YHR139C	TAF7	Q05021	590 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPS100	YHR139C	ULS1	Q08562	1619 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPS100	YHR139C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPS100	YHR139C	LTE1	P07866	1435 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPS100	YHR139C	RTT106	P40161	455 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPS100	YHR139C	VPS15	P22219	1454 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SPS100	YHR139C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SPS100	YHR139C	IFH1	P39520	1085 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPS100	YHR139C	MET10	P39692	1035 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPS100	YHR139C	SPO14	P36126	1683 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPS100	YHR139C	IRC20	Q06554	1556 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPS100	YHR139C	PDR12	Q02785	1511 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPS100	YHR139C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPS100	YHR139C	BNI1	P41832	1953 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPS100	YHR139C	GDB1	Q06625	1536 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	ITT1	Q04638	464 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	DRS2	P39524	1355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	NUP170	P38181	1502 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SPS100	YHR139C	PDR10	P51533	1564 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPS100	YHR139C	CAT8	P39113	1433 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPS100	YHR139C	YBT1	P32386	1661 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPS100	YHR139C	IQG1	Q12280	1495 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SPS100	YHR139C	BUD3	P25558	1636 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPS100	YHR139C	MMS1	Q06211	1407 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SPS100	YHR139C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPS100	YHR139C	DOP1	Q03921	1698 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SPS100	YHR139C	CKB1	P43639	278 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SPS100	YHR139C	TRM3	Q07527	1436 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SPS100	YHR139C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SPS100	YHR139C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPS100	YHR139C	YSP2	Q06681	1438 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPS100	YHR139C	SRB8	P25648	1427 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPS100	YHR139C	DNF2	Q12675	1612 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPS100	YHR139C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPS100	YHR139C	BNR1	P40450	1375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPS100	YHR139C	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPS100	YHR139C	SSM4	P40318	1319 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SPS100	YHR139C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SPS100	YHR139C	YOR093C	Q12275	1648 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SPS100	YHR139C	MIF2	P35201	549 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SPS100	YHR139C	YAP3	P38749	330 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SPS100	YHR139C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SPS100	YHR139C	GCN2	P15442	1659 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SPS100	YHR139C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SPS100	YHR139C	DNF3	Q12674	1656 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPS100	YHR139C	VMR1	P38735	1592 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPS100	YHR139C	IPL1	P38991	367 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPS100	YHR139C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SPS100	YHR139C	IML1	P47170	1584 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SPS100	YHR139C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SPS100	YHR139C	MAK10	Q02197	733 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPS100	YHR139C	PAF1	P38351	445 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPS100	YHR139C	PDR11	P40550	1411 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPS100	YHR139C	HAP1	P0CE41	1502 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPS100	YHR139C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SPS100	YHR139C	RAV1	P47104	1357 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SPS100	YHR139C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SPS100	YHR139C	YFR006W	P43590	535 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SPS100	YHR139C	USO1	P25386	1790 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SPS100	YHR139C	RTC1	Q08281	1341 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPS100	YHR139C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPS100	YHR139C	NUP192	P47054	1683 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPS100	YHR139C	BCK1	Q01389	1478 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SPS100	YHR139C	MRX12	P47084	519 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	KRE5	P22023	1365 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	YMR196W	Q04336	1088 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	RAD9	P14737	1309 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	ESL2	P36168	1195 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	TAF5	P38129	798 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	RIA1	P53893	1110 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	CAB1	Q04430	367 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SPS100	YHR139C	THI12	P42883	340 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPS100	YHR139C	THI5	P43534	340 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPS100	YHR139C	THI11	P47183	340 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPS100	YHR139C	THI13	Q07748	340 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPS100	YHR139C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	TAF8	Q03750	510 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPS100	YHR139C	SPE2	P21182	396 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPS100	YHR139C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPS100	YHR139C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SPS100	YHR139C	RCM1	P53972	490 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SPS100	YHR139C	CPS1	P27614	576 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPS100	YHR139C	SCT1	P32784	759 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPS100	YHR139C	PPH3	P32345	308 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPS100	YHR139C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53

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