RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C HTA2P04912 132 aa4.45□□□□□ -1.7
STF2YGR008C RCR1P38212 213 aa4.45□□□□□ -1.7
STF2YGR008C YEL023CP39992 682 aa4.45□□□□□ -1.7
STF2YGR008C XDJ1P39102 459 aa4.44□□□□□ -1.7
STF2YGR008C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
STF2YGR008C RGA2Q06407 1009 aa4.42□□□□□ -1.7
STF2YGR008C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
STF2YGR008C PTC4P38089 393 aa4.4□□□□□ -1.71
STF2YGR008C PML39Q03760 334 aa4.4□□□□□ -1.71
STF2YGR008C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data4.37□□□□□ -1.71not detected
STF2YGR008C ABP1P15891 592 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
STF2YGR008C SRC1Q03707 834 aa4.35□□□□□ -1.71
STF2YGR008C SSP1P38871 571 aa4.34□□□□□ -1.71
STF2YGR008C MID1P41821 548 aa4.33□□□□□ -1.72
STF2YGR008C RGA1P39083 1007 aa4.31□□□□□ -1.72
STF2YGR008C MGA2P40578 1113 aa4.3□□□□□ -1.72
STF2YGR008C PEX29Q03370 554 aa4.28□□□□□ -1.72
STF2YGR008C ARH1P48360 493 aa4.27□□□□□ -1.73
STF2YGR008C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
STF2YGR008C MIF2P35201 549 aa4.24□□□□□ -1.73
STF2YGR008C SPT23P35210 1082 aa4.23□□□□□ -1.73
STF2YGR008C ATH1P48016 1211 aa4.23□□□□□ -1.73
STF2YGR008C DNA2P38859 1522 aa4.21□□□□□ -1.73
STF2YGR008C RAS1P01119 309 aa4.21□□□□□ -1.74
STF2YGR008C HAP5Q02516 242 aa4.2□□□□□ -1.74
STF2YGR008C PTC2P39966 464 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
STF2YGR008C GUT1P32190 709 aa4.17□□□□□ -1.74
STF2YGR008C PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
STF2YGR008C EDS1P38073 919 aa4.17□□□□□ -1.74
STF2YGR008C SOL3P38858 249 aa4.16□□□□□ -1.74
STF2YGR008C NST1P53935 1240 aa4.16□□□□□ -1.74
STF2YGR008C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
STF2YGR008C ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
STF2YGR008C BNI4P53858 892 aa4.14□□□□□ -1.75
STF2YGR008C TFA1P36100 482 aa4.13□□□□□ -1.75
STF2YGR008C MPC54Q08550 464 aa4.13□□□□□ -1.75
STF2YGR008C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
STF2YGR008C YPR015CQ12531 247 aa4.11□□□□□ -1.75
STF2YGR008C MPH3P0CE00 602 aa4.1□□□□□ -1.75
STF2YGR008C AI4P03878 556 aa4.09□□□□□ -1.75
STF2YGR008C NMA111P53920 997 aa4.09□□□□□ -1.75
STF2YGR008C TRK1P12685 1235 aa4.08□□□□□ -1.76
STF2YGR008C MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
STF2YGR008C COQ8P27697 501 aa4.06□□□□□ -1.76
STF2YGR008C RAM2P29703 316 aa4.06□□□□□ -1.76
STF2YGR008C GYP1Q08484 637 aa4.06□□□□□ -1.76
STF2YGR008C AMS1P22855 1083 aa4.04□□□□□ -1.76
STF2YGR008C SLI15P38283 698 aa4.04□□□□□ -1.76
STF2YGR008C KOG1P38873 1557 aa4.03□□□□□ -1.76
STF2YGR008C YPL062WQ02781 134 aa4.02□□□□□ -1.77
STF2YGR008C DPL1Q05567 589 aa4.02□□□□□ -1.77
STF2YGR008C RAM1P22007 431 aa4.01□□□□□ -1.77
STF2YGR008C YGR273CP53329 174 aa4.01□□□□□ -1.77
STF2YGR008C SDH2P21801 266 aa4□□□□□ -1.77
STF2YGR008C PDR1P12383 1068 aa3.99□□□□□ -1.77
STF2YGR008C GAR1P28007 205 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
STF2YGR008C CDC73Q06697 393 aa3.97□□□□□ -1.77
STF2YGR008C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data3.96□□□□□ -1.78not detected
STF2YGR008C ISU2Q12056 156 aa3.94□□□□□ -1.78
STF2YGR008C AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
STF2YGR008C YEL077CQ3E7X8 1277 aa3.93□□□□□ -1.78
STF2YGR008C CLA4P48562 842 aa3.91□□□□□ -1.78
STF2YGR008C SWR1Q05471 1514 aa3.9□□□□□ -1.78
STF2YGR008C KEX1P09620 729 aa3.9□□□□□ -1.79
STF2YGR008C BRE2P43132 505 aa3.9□□□□□ -1.79
STF2YGR008C SAS4Q04003 481 aa3.87□□□□□ -1.79
STF2YGR008C CST6P40535 587 aa3.85□□□□□ -1.79
STF2YGR008C VHR2P40041 505 aa3.84□□□□□ -1.79
STF2YGR008C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
STF2YGR008C GCR2Q01722 534 aa3.83□□□□□ -1.8
STF2YGR008C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
STF2YGR008C ERG12P07277 443 aa3.82□□□□□ -1.8
STF2YGR008C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
STF2YGR008C PRT1P06103 763 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
STF2YGR008C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
STF2YGR008C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data3.8□□□□□ -1.8not detected
STF2YGR008C STR2P47164 639 aa3.8□□□□□ -1.8
STF2YGR008C YRR1Q12172 810 aa3.8□□□□□ -1.8
STF2YGR008C ISM1P48526 1002 aa3.79□□□□□ -1.8
STF2YGR008C MET22P32179 357 aa3.78□□□□□ -1.8
STF2YGR008C RAD54P32863 898 aa3.77□□□□□ -1.81
STF2YGR008C UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
STF2YGR008C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
STF2YGR008C PEX21P50091 288 aa3.76□□□□□ -1.81
STF2YGR008C NUD1P32336 851 aa3.75□□□□□ -1.81
STF2YGR008C LAM6Q08001 693 aa3.75□□□□□ -1.81
STF2YGR008C GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
STF2YGR008C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
STF2YGR008C YDR444WQ04093 687 aa3.73□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-DR4O74302 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-AP0CX57 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-PR1P0CX58 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-ORP0CX59 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-PR2P0CX60 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-DR5P0CX65 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-ER2P0CX66 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-GR3P0CX67 440 aa3.72□□□□□ -1.81
STF2YGR008C TY1A-LR1P0CX68 440 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms