RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W YGR273CP53329 174 aa7.75□□□□□ -1.17
SPT15YER148W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SPT15YER148W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SPT15YER148W HTA2P04912 132 aa7.74□□□□□ -1.17
SPT15YER148W DCW1P36091 449 aa7.73□□□□□ -1.17
SPT15YER148W SOL3P38858 249 aa7.73□□□□□ -1.17
SPT15YER148W NST1P53935 1240 aa7.73□□□□□ -1.17
SPT15YER148W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
SPT15YER148W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
SPT15YER148W COX6P00427 148 aa7.7□□□□□ -1.18
SPT15YER148W SPP1Q03012 353 aa7.69□□□□□ -1.18
SPT15YER148W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SPT15YER148W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SPT15YER148W VHR2P40041 505 aa7.68□□□□□ -1.18
SPT15YER148W MAM3Q12296 706 aa7.68□□□□□ -1.18
SPT15YER148W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
SPT15YER148W AI4P03878 556 aa7.67□□□□□ -1.18
SPT15YER148W ULI1P43604 169 aa7.67□□□□□ -1.18
SPT15YER148W YDR090CQ03193 310 aa7.67□□□□□ -1.18
SPT15YER148W MPH3P0CE00 602 aa7.66□□□□□ -1.18
SPT15YER148W YEL023CP39992 682 aa7.66□□□□□ -1.18
SPT15YER148W KEX1P09620 729 aa7.65□□□□□ -1.18
SPT15YER148W RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPT15YER148W JIP4Q03361 876 aa7.65□□□□□ -1.18
SPT15YER148W IOC2Q12072 812 aa7.65□□□□□ -1.18
SPT15YER148W PTC4P38089 393 aa7.64□□□□□ -1.19
SPT15YER148W RAD54P32863 898 aa7.62□□□□□ -1.19
SPT15YER148W IES2P40154 320 aa7.61□□□□□ -1.19
SPT15YER148W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.6□□□□□ -1.19not detected
SPT15YER148W KIC1P38692 1080 aa7.6□□□□□ -1.19
SPT15YER148W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SPT15YER148W DAN4P47179 1161 aa7.6□□□□□ -1.19
SPT15YER148W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SPT15YER148W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SPT15YER148W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SPT15YER148W LDB19Q12502 818 aa7.56□□□□□ -1.2
SPT15YER148W SEC61P32915 480 aa7.55□□□□□ -1.2
SPT15YER148W DIT2P21595 489 aa7.54□□□□□ -1.2
SPT15YER148W RTG1P32607 177 aa7.53□□□□□ -1.2
SPT15YER148W SLI15P38283 698 aa7.52□□□□□ -1.21
SPT15YER148W AIM7Q12156 149 aa7.52□□□□□ -1.21
SPT15YER148W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SPT15YER148W ORC6P38826 435 aa7.51□□□□□ -1.21
SPT15YER148W FKH1P40466 484 aa7.49□□□□□ -1.21
SPT15YER148W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SPT15YER148W GLC3P32775 704 aa7.48□□□□□ -1.21
SPT15YER148W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SPT15YER148W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SPT15YER148W PML39Q03760 334 aa7.46□□□□□ -1.22
SPT15YER148W NCR1Q12200 1170 aa7.46□□□□□ -1.22
SPT15YER148W CSC1Q06538 782 aa7.44□□□□□ -1.22
SPT15YER148W YDL129WQ07555 291 aa7.44□□□□□ -1.22
SPT15YER148W KIN1P13185 1064 aa7.43□□□□□ -1.22
SPT15YER148W MID1P41821 548 aa7.43□□□□□ -1.22
SPT15YER148W ATF2P53296 535 aa7.43□□□□□ -1.22
SPT15YER148W CDC73Q06697 393 aa7.42□□□□□ -1.22
SPT15YER148W RGR1P19263 1082 aa7.41□□□□□ -1.22
SPT15YER148W DPL1Q05567 589 aa7.41□□□□□ -1.22
SPT15YER148W MPC54Q08550 464 aa7.41□□□□□ -1.22
SPT15YER148W TFB4Q12004 338 aa7.41□□□□□ -1.22
SPT15YER148W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SPT15YER148W CLB5P30283 435 aa7.4□□□□□ -1.22
SPT15YER148W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SPT15YER148W PEX29Q03370 554 aa7.37□□□□□ -1.23
SPT15YER148W SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SPT15YER148W TEA1P47988 759 aa7.35□□□□□ -1.23
SPT15YER148W ISU2Q12056 156 aa7.35□□□□□ -1.23
SPT15YER148W PEX21P50091 288 aa7.34□□□□□ -1.23
SPT15YER148W NMA111P53920 997 aa7.34□□□□□ -1.23
SPT15YER148W SAP30P38429 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SPT15YER148W ARH1P48360 493 aa7.33□□□□□ -1.24
SPT15YER148W YPR109WQ06104 294 aa7.32□□□□□ -1.24
SPT15YER148W HAP5Q02516 242 aa7.3□□□□□ -1.24
SPT15YER148W TAF7Q05021 590 aa7.29□□□□□ -1.24
SPT15YER148W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPT15YER148W BMT6Q12291 365 aa7.29□□□□□ -1.24
SPT15YER148W GUA1P38625 525 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SPT15YER148W YJL171CP46992 396 aa7.27□□□□□ -1.25
SPT15YER148W HPC2Q01448 625 aa7.27□□□□□ -1.25
SPT15YER148W YRR1Q12172 810 aa7.27□□□□□ -1.25
SPT15YER148W BNI4P53858 892 aa7.26□□□□□ -1.25
SPT15YER148W SIT4P20604 311 aa7.25□□□□□ -1.25
SPT15YER148W DMA2P53924 522 aa7.25□□□□□ -1.25
SPT15YER148W NIS1P53939 407 aa7.25□□□□□ -1.25
SPT15YER148W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SPT15YER148W CSN12P47130 423 aa7.24□□□□□ -1.25
SPT15YER148W YDR344CQ05510 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SPT15YER148W SPT23P35210 1082 aa7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W PRE3P38624 215 aa7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W HST2P53686 357 aa7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W FPK1P53739 893 aa7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPT15YER148W RTF1P53064 558 aa7.21□□□□□ -1.26
SPT15YER148W YMR196WQ04336 1088 aa7.21□□□□□ -1.26
SPT15YER148W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SPT15YER148W NUD1P32336 851 aa7.2□□□□□ -1.26
SPT15YER148W PDR1P12383 1068 aa7.19□□□□□ -1.26
SPT15YER148W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SPT15YER148W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms