RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W PTC4P38089 393 aa9.42□□□□□ -0.9
NSE4YDL105W YEL023CP39992 682 aa9.4□□□□□ -0.9
NSE4YDL105W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
NSE4YDL105W BCK2P33306 851 aa9.34□□□□□ -0.91
NSE4YDL105W PRE3P38624 215 aa9.33□□□□□ -0.92
NSE4YDL105W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NSE4YDL105W MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NSE4YDL105W MIF2P35201 549 aa9.25□□□□□ -0.93
NSE4YDL105W ATH1P48016 1211 aa9.24□□□□□ -0.93
NSE4YDL105W GUT1P32190 709 aa9.23□□□□□ -0.93
NSE4YDL105W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NSE4YDL105W RAM2P29703 316 aa9.2□□□□□ -0.94
NSE4YDL105W PML39Q03760 334 aa9.2□□□□□ -0.94
NSE4YDL105W EDS1P38073 919 aa9.17□□□□□ -0.94
NSE4YDL105W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
NSE4YDL105W COQ8P27697 501 aa9.12□□□□□ -0.95
NSE4YDL105W VRP1P37370 817 aa9.12□□□□□ -0.95
NSE4YDL105W XDJ1P39102 459 aa9.12□□□□□ -0.95
NSE4YDL105W NST1P53935 1240 aa9.1□□□□□ -0.95
NSE4YDL105W ARH1P48360 493 aa9.09□□□□□ -0.95
NSE4YDL105W YDR344CQ05510 147 aa9.08□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W AI4P03878 556 aa9.06□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W MPH3P0CE00 602 aa9.05□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W SOL3P38858 249 aa9.04□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W MID1P41821 548 aa9.04□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W PEX29Q03370 554 aa9.03□□□□□ -0.96
NSE4YDL105W SPT23P35210 1082 aa9□□□□□ -0.97
NSE4YDL105W HAP5Q02516 242 aa8.96□□□□□ -0.98
NSE4YDL105W YGR273CP53329 174 aa8.94□□□□□ -0.98
NSE4YDL105W DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NSE4YDL105W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NSE4YDL105W BNI4P53858 892 aa8.91□□□□□ -0.98
NSE4YDL105W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NSE4YDL105W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
NSE4YDL105W MPC54Q08550 464 aa8.87□□□□□ -0.99
NSE4YDL105W NMA111P53920 997 aa8.82□□□□□ -1
NSE4YDL105W SLI15P38283 698 aa8.81□□□□□ -1
NSE4YDL105W DPL1Q05567 589 aa8.8□□□□□ -1
NSE4YDL105W KEX1P09620 729 aa8.73□□□□□ -1.01
NSE4YDL105W ISU2Q12056 156 aa8.72□□□□□ -1.01
NSE4YDL105W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NSE4YDL105W SRC1Q03707 834 aa8.66□□□□□ -1.02
NSE4YDL105W RAM1P22007 431 aa8.63□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W CDC73Q06697 393 aa8.62□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W YPR015CQ12531 247 aa8.62□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W GYP1Q08484 637 aa8.6□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W VHR2P40041 505 aa8.59□□□□□ -1.03
NSE4YDL105W RAD54P32863 898 aa8.57□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W RGA2Q06407 1009 aa8.57□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W RAS1P01119 309 aa8.56□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.56□□□□□ -1.04not detected
NSE4YDL105W SAS4Q04003 481 aa8.56□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W AMS1P22855 1083 aa8.53□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W IFH1P39520 1085 aa8.53□□□□□ -1.04
NSE4YDL105W PDR1P12383 1068 aa8.52□□□□□ -1.05
NSE4YDL105W KIC1P38692 1080 aa8.48□□□□□ -1.05
NSE4YDL105W YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.45□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W TRK1P12685 1235 aa8.44□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W PEX21P50091 288 aa8.44□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W YDR090CQ03193 310 aa8.44□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W SDH2P21801 266 aa8.41□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W RGA1P39083 1007 aa8.41□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W CSC1Q06538 782 aa8.4□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W YRR1Q12172 810 aa8.4□□□□□ -1.06
NSE4YDL105W TFB4Q12004 338 aa8.39□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W YPR148CQ06523 435 aa8.36□□□□□ -1.07
NSE4YDL105W STR2P47164 639 aa8.32□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W ERG12P07277 443 aa8.31□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W NUD1P32336 851 aa8.31□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W NPL4P33755 580 aa8.31□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W ISM1P48526 1002 aa8.3□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NSE4YDL105W ORC6P38826 435 aa8.27□□□□□ -1.09
NSE4YDL105W COX6P00427 148 aa8.25□□□□□ -1.09
NSE4YDL105W VPS70P47161 811 aa8.23□□□□□ -1.09
NSE4YDL105W GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NSE4YDL105W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NSE4YDL105W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-DR4O74302 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-AP0CX57 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-ORP0CX59 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W CST6P40535 587 aa8.18□□□□□ -1.1
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