RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641017.1

GABRG2-229, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit, human

BASIC

Gene GABRG2, Length 3,628 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRG2-229	ENST00000641017	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		5.14	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	TRIM41	Q8WV44	630 aa		5.13	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	HMGXB3	Q12766	1538 aa		5.12	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	POTEH	Q6S545	545 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	RGL2	O15211	777 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	NCAPD3	P42695	1498 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GABRG2-229	ENST00000641017	NEUROD2	Q15784	382 aa		5.09	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	PROM2	Q8N271	834 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	TOP2B	Q02880	1626 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-229	ENST00000641017	SYNJ1	O43426	1573 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	KIF21B	O75037	1637 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	SPOCK2	Q92563	424 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	CUX2	O14529	1486 aa		5	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	WDR97	A6NE52	1622 aa		5	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	MIER1	Q8N108	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	HRC	P23327	699 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GABRG2-229	ENST00000641017	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	CFTR	P13569	1480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	EEA1	Q15075	1411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	CUX1	P39880	1505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	APBB1	O00213	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	STK25	O00506	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-229	ENST00000641017	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	NES	P48681	1621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	RAD21	O60216	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	WDR62	O43379	1518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	MYT1	Q01538	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	SOGA1	O94964	1423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	CAPN15	O75808	1086 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	PLEKHG5	O94827	1062 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	POLA2	Q14181	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	APLP2	Q06481	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-229	ENST00000641017	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	CUL7	Q14999	1698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-229	ENST00000641017	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms