RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640799.1

C1orf43-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C1orf43, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-210ENST00000640799 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
C1orf43-210ENST00000640799 CUL7Q14999 1698 aa30.86■■■□□ 2.53
C1orf43-210ENST00000640799 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.76■■■□□ 2.51
C1orf43-210ENST00000640799 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.75■■■□□ 2.51
C1orf43-210ENST00000640799 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.5■■■□□ 2.47
C1orf43-210ENST00000640799 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.5■■■□□ 2.47
C1orf43-210ENST00000640799 IQGAP2Q13576 1575 aa30.49■■■□□ 2.47
C1orf43-210ENST00000640799 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.43■■■□□ 2.46
C1orf43-210ENST00000640799 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
C1orf43-210ENST00000640799 PTPRGP23470 1445 aa30.41■■■□□ 2.46
C1orf43-210ENST00000640799 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.41■■■□□ 2.46
C1orf43-210ENST00000640799 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
C1orf43-210ENST00000640799 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf43-210ENST00000640799 MAPKBP1O60336 1514 aa30.37■■■□□ 2.45
C1orf43-210ENST00000640799 DISP1Q96F81 1524 aa30.36■■■□□ 2.45
C1orf43-210ENST00000640799 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.32■■■□□ 2.44
C1orf43-210ENST00000640799 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.32■■■□□ 2.44
C1orf43-210ENST00000640799 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.3■■■□□ 2.44
C1orf43-210ENST00000640799 PRXQ9BXM0 1461 aa30.26■■■□□ 2.44
C1orf43-210ENST00000640799 DIP2BQ9P265 1576 aa30.26■■■□□ 2.43
C1orf43-210ENST00000640799 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.23■■■□□ 2.43
C1orf43-210ENST00000640799 KIAA0556O60303 1618 aa30.22■■■□□ 2.43
C1orf43-210ENST00000640799 ABCC2Q92887 1545 aa30.22■■■□□ 2.43
C1orf43-210ENST00000640799 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.19■■■□□ 2.42
C1orf43-210ENST00000640799 UACAQ9BZF9 1416 aa30.19■■■□□ 2.42
C1orf43-210ENST00000640799 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.1■■■□□ 2.41
C1orf43-210ENST00000640799 ASXL2Q76L83 1435 aa30.1■■■□□ 2.41
C1orf43-210ENST00000640799 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.06■■■□□ 2.4
C1orf43-210ENST00000640799 GOLGA3Q08378 1498 aa30.06■■■□□ 2.4
C1orf43-210ENST00000640799 TSPOAP1O95153 1857 aa30.05■■■□□ 2.4
C1orf43-210ENST00000640799 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.05■■■□□ 2.4
C1orf43-210ENST00000640799 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
C1orf43-210ENST00000640799 EEA1Q15075 1411 aa29.97■■■□□ 2.39
C1orf43-210ENST00000640799 GLI2P10070 1586 aa29.97■■■□□ 2.39
C1orf43-210ENST00000640799 ABCA8O94911 1581 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 KDM6BO15054 1643 aa29.92■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 P3H3Q8IVL6 736 aa29.9■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
C1orf43-210ENST00000640799 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
C1orf43-210ENST00000640799 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.83■■■□□ 2.37
C1orf43-210ENST00000640799 SAMD9Q5K651 1589 aa29.83■■■□□ 2.37
C1orf43-210ENST00000640799 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.83■■■□□ 2.37
C1orf43-210ENST00000640799 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.8■■■□□ 2.36
C1orf43-210ENST00000640799 KIF21BO75037 1637 aa29.74■■■□□ 2.35
C1orf43-210ENST00000640799 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
C1orf43-210ENST00000640799 ARID3CA6NKF2 412 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf43-210ENST00000640799 KCNH8Q96L42 1107 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf43-210ENST00000640799 ATP10BO94823 1461 aa29.7■■■□□ 2.35
C1orf43-210ENST00000640799 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
C1orf43-210ENST00000640799 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.68■■■□□ 2.34
C1orf43-210ENST00000640799 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.65■■■□□ 2.34
C1orf43-210ENST00000640799 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.64■■■□□ 2.34
C1orf43-210ENST00000640799 CD109Q6YHK3 1445 aa29.63■■■□□ 2.33
C1orf43-210ENST00000640799 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.63■■■□□ 2.33
C1orf43-210ENST00000640799 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.6■■■□□ 2.33
C1orf43-210ENST00000640799 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.59■■■□□ 2.33
C1orf43-210ENST00000640799 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
C1orf43-210ENST00000640799 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.55■■■□□ 2.32
C1orf43-210ENST00000640799 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.55■■■□□ 2.32
C1orf43-210ENST00000640799 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
C1orf43-210ENST00000640799 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
C1orf43-210ENST00000640799 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
C1orf43-210ENST00000640799 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf43-210ENST00000640799 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf43-210ENST00000640799 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
C1orf43-210ENST00000640799 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.36■■■□□ 2.29
C1orf43-210ENST00000640799 ADGRL1O94910 1474 aa29.35■■■□□ 2.29
C1orf43-210ENST00000640799 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
C1orf43-210ENST00000640799 FMN1Q68DA7 1419 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf43-210ENST00000640799 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf43-210ENST00000640799 NEO1Q92859 1461 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf43-210ENST00000640799 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.275e-8■■■□□ 14.8
C1orf43-210ENST00000640799 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
C1orf43-210ENST00000640799 RAPGEF3O95398 923 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf43-210ENST00000640799 HECW1Q76N89 1606 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf43-210ENST00000640799 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf43-210ENST00000640799 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf43-210ENST00000640799 FANCAO15360 1455 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf43-210ENST00000640799 AKNAQ7Z591 1439 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf43-210ENST00000640799 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf43-210ENST00000640799 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.09■■■□□ 2.25
C1orf43-210ENST00000640799 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
C1orf43-210ENST00000640799 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 RICTORQ6R327 1708 aa29.06■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 PLCH2O75038 1416 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 KIF14Q15058 1648 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf43-210ENST00000640799 CLIP1P30622 1438 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf43-210ENST00000640799 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.98■■■□□ 2.23
C1orf43-210ENST00000640799 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.95■■■□□ 2.23
C1orf43-210ENST00000640799 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf43-210ENST00000640799 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf43-210ENST00000640799 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf43-210ENST00000640799 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.93■■■□□ 2.22
C1orf43-210ENST00000640799 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.93■■■□□ 2.22
C1orf43-210ENST00000640799 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms